核酸电泳相关试剂、缓冲液的配制方法
50×TAE Buffer (pH8.5)
组份浓度 2 M Tris-醋酸,100 mM EDTA
配制量 1 L
配制方法 1.称量下列试剂,置于1 L烧杯中。
Tris |
242 g |
Na2EDTA·2H2O |
37.2 g |
2.向烧杯中加入约800 ml的去离子水,充分搅拌溶解。
3.加入57.1 ml的乙酸,充分搅拌。
4.加去离子水将溶液定容至l L后,室温保存。
10×TBE Buffer (pH8.3)
组份浓度 890 mM Tris-硼酸,20 mM EDTA
配制量 1 L
配制方法 l.称量下列试剂,置于l L烧杯中。
Tris |
108 g |
Na2EDTA·2H2O |
7.44 g |
硼酸 |
55 g |
2.向烧杯中加入约800 ml的去离子水,充分搅拌溶解。
3.加去离子水将溶液定容至l L后,室温保存。
10×MOPS(3-吗啉基丙磺酸)Buffer
组份浓度 200 rnM MOPS,20 mM NaOAc,10 mM EDTA
配制量 1 L
配制方法 1.称41.8 g MOPS,置于1 L烧杯中。
2.加约700 ml DEPC处理水,搅拌溶解。
3.使用2 N NaOH调节pH值至7.0。
4.再向溶液中加入下列试剂。
1 M NaOAc(DEPC处理) |
20 ml |
0.5 M EDTA(pH8.0)(DEPC处理) |
20 ml |
5.用DEPC处理水将溶液定容至1 L。
6.用0.45 m滤膜过滤除去杂质。
7.室温避光保存。
注:溶液见光或高温灭菌后会变黄。变黄时也可使用,但变黑时不要使用。
溴乙锭 (10 mg/ml)
组份浓度 10 mg/ml溴乙锭
配制量 100 ml
配制方法 1.称量1 g溴乙锭,加入到100 ml容器中。
2.加入去离子水100 ml,充分搅拌数h完全溶解溴乙锭。
3.将溶液转移至棕色瓶中,室温避光保存。
4.溴乙锭的工作浓度为0.5 g/ml。
注意:溴乙锭是一种致癌物质,必须小心操作。
Agarose凝胶
配制方法 1.配制适量的电泳及制胶用的缓冲液(通常是0.5×TBE或1×TAE)。
2.根椐制胶量及凝胶浓度,准确称量琼脂糖粉,加入适当的锥形瓶中。
3.加入一定量的电泳缓冲液(总液体量不宜超过锥形瓶的50%容量)。
注:用于电泳的缓冲液和用于制胶的缓冲液必须统一。
4.在锥形瓶的瓶封上保鲜膜,并在膜上扎些小孔,然后在微波炉中加热熔化琼脂糖。加热过程中,当溶液沸腾后,请戴上防热手套。小心摇动锥形瓶。使琼脂糖充分均匀熔化。此操作重复数次,直至琼脂糖完全熔化。必须注意,在微波炉中加热时间不宜过长,每次当溶液起泡沸腾时停止加热,否则会引起溶液过热暴沸,造成琼脂糖凝胶浓度不准,也会损坏微波炉。熔化琼脂糖时,必须保证琼脂糖充分完全熔化,否则,会造成电泳图像模糊不清。
5.使溶液冷却至60℃左右,如需要可在此时加入溴乙锭溶液(终浓度0.5 µg/ml)。并充分混匀。
注:溴乙锭是一种致癌物质。使用含有溴乙锭的溶液时,请戴好手套。
6.将琼脂糖溶液倒入制胶模中,然后在适当位置处插上梳子。凝胶厚度 一般在3~5 min之间。
7.在室温下使胶凝固(大约30 min~1 h),然后放置于电泳槽中进行电泳。
注:凝胶不立即使用时,请用保鲜膜将凝胶包好后在4℃下保存,一 般可保存2~5天。
琼脂糖凝胶浓度与线形DNA的最佳分辨范围
琼脂糖浓度 |
最佳线形DNA分辨范围(bp) |
0.5% 0.7% 1.0% 1.2% 1.5% 2.0% |
1,000~30,000 800~12,000 500~10,000 400~7,000 200~3,000 50~2,000 |
6 × Loading Buffer(DNA电泳用)
组份浓度
30 mM |
EDTA |
36%(V/V) |
Glycerol |
0.05%(W/V) |
Xylene Cyanol FF |
0.05%(W/V) |
Bromophenol Blue |
配制量 500 ml
配制方法 1.称量下列试剂,置于500 ml烧杯中。
EDTA |
4.4g |
Bromophenol Blue |
250 mg |
Xylene Cyanol FF |
250 mg |
2.向烧杯中加入约200 ml的去离子水后,加热搅拌充分溶解。
3.加入180 ml的甘油(Glycerol)后,使用2 N NaOH调节pH值至7.0。
4.用去离子水定容至500 ml后,室温保存。
10 × Loadlng Buffer (RNA电泳用)
组份浓度
10 mM |
EDTA |
50%(V/V) |
Glycerol |
0.25%(W/V) |
Xylene Cyanol FF |
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