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2016新一代单细胞定量ISH技术培训通知

作者:Advanced Cell Diagnostics (ACD) 2016-06-21T15:21 (访问量:5840)

新一代单细胞水平原位定量杂交技术及应用培训班

2016年7月9日-10 
北京 中国科学院生物物理研究所
 
课程背景】
近年来转录组分析在癌症研究的广泛使用已证明,RNA 与蛋白质一样可以作为具有临床诊断,评估以及治疗预后展望价值的生物指标。尽管这种转录组分析可以找到许多潜在的生物标记物,将这些发现转化为临床检测常规使用的RNA 生物标记物则面临诸多技术方面的挑战。虽然单个细胞原位检测和可视化DNA 和蛋白质很普遍,直到目前为止RNA 分析最好的常规检测手段仍停留在液态检测并量化RNA。这些方法只能提供测量细胞群的一个“平均数”,掩盖了RNA 表达在细胞之间惊人的变异程度。由于其在生理功能中的特殊作用,蛋白质一直作为普遍使用的生物标记物为疾病治疗提供检测依据,同时也使得它的检测技术得以完善。由于缺乏有效的RNA 原位检测方法往往导致使用DNA 和蛋白质作为替代物来检测那些最初发现的RNA 生物标记物,然而这种做法存在问题。RNA 表达的变化可能不是源于DNA 改变,也不一定与蛋白质水平相同或者可能没有相应的蛋白相对应,例如非编码RNA。总之,利用基因芯片或RNA-seq发现的RNA 作为生物标记物时,最好的方法是直接原位检测RNA;因为使用DNA 或蛋白质替代,或基于溶液的RNA 分析,不可避免地将导致信息丢失,使RNA 生物标记物的整体诊断效用大打折扣。
本次高级研修班旨在学习和使用新一代单细胞水平RNAscope原位定量可视化技术,为生命科学研究领域的老师和同学们提供一次高水准的分子病理学专业培训。培训内容涵盖了从传统原位杂交的发展介绍到新一代单细胞水平RNA原位定量可视化技术的出现;聘请专家对使用RNAscope技术研究肿瘤、感染性疾病等的分子病理机制方面进行专题讲座和学术交流;对多色化学及荧光原位定量杂交技术原理、图像采集、数据分析等进行专题技术讲解;并设置了完整的RNAscope技术现场教学实践。采用理论、技术再到科研中的具体应用相结合的方式,系统、详细的介绍RNAscope单细胞水平原位定量杂交的原理、具体方法等;通过现场原位杂交实验及图像采集分析等教学,使大家真正做到知其然且知其所以然,充分理解并掌握相关技术。
 
【专家介绍】
蔡车国博士
中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所
2010 年至 2011 年于美国杜兰大学从事博士后研究工作,研究方向为抗肿瘤多肽合成药物的筛选与机制研究。2012 年于中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所先后从事博士后和副研究员工作。期间一直从事乳腺干细胞与乳腺发育方面的工作,在微环境因子调控乳腺干细胞干性维持的研究中鉴定出一个新的影响乳腺干细胞自我更新的Wnt信号通路因子 Rspo1,发表在学术期刊 Genes Dev。在对乳腺干细胞重要特征基因的鉴定中与他人合作鉴定出乳腺干细胞的表面分子标记Procr,发表在学术期刊 Nature。在细胞周期蛋白调控乳腺干细胞与乳腺发育中的作用研究中与他人合作鉴定了细胞周期蛋白CCNY 和 CCNYL1 在乳腺干细胞和乳腺发育中的作用,发表在学术期刊PLoS Genetics。主持国家博士后基金,国家自然科学基金委青年科学基金,国家自然科学基金委面上基金,并以主要负责人参与了中国科学院干细胞先导项目,重大专项项目,国家 973 项目等多个项目;并为国际干细胞协会 ISSCR 会员,Journal of stem cell biology、 Research & Therapy 学术期刊编委
报告内容:
介绍影响乳腺干细胞自我更新的微环境因子的发现和细胞周期蛋白在调控乳腺干细胞自我更新中的作用机制。以及RNAscope技术在干细胞生物学研究中的应用和优势。
 
宋宁博士
上海交通大学医学院上海市生殖医学重点实验室
上海市青年东方学者,亚洲男科学协会青年委员。从事生殖系统功能及形态学研究,综合利用形态学、生物信息学、分子生物学等研究方法重点研究精子发生过程中的组蛋白修饰、lncRNAs功能研究、染色质重塑等表观遗传学调控机制。发表SCI论文5篇,单篇被引次数46次,授权发明**1项。第14届国际组织细胞化学会“Young Scientist Best Poster Award”。主持国家自然科学基金1项,上海市课题3项。
报告内容:
原位杂交(ISH)技术是在组织切片上检测并观察特定RNA/DNA分布情况的重要形态学方法。在传统ISH技术的使用过程中,成功的实验操作和结果的评价主要依赖于“熟练”与“必要的对照实验”。基于我们多年的实际操作经验,本次分享中,介绍ISH的实验准备过程、实验材料的选择与固定方案、RNA保存状态的评价方法、切片时的注意事项。简述传统ISH技术的探针设计方法和难点,重点介绍创新的RNAscope原位杂交技术的特点与优势,并结合实际研究课题展示其染色结果。
 
【课程安排】

第一天 201679

时间

地点

项目

授课内容

主讲人

主持人

8:30-9:00

9501会议室

报到

9:00-9:30

9501会议室

开幕式

中国科学院动物实验资源平台

田勇

田勇

 

 

 

 

 

 

 

北京市实验动物管理办公室主任

李根平

国家动物海绵状脑病检测实验室主任、北京实验动物行业协会理事长

赵德明

9:30-10:00

9501会议室

合影

全体人员

 

10:00-11:00

9501会议室

学术报告

乳腺干细胞干性维持的分子调控

蔡车国

提问和交流

11:00-12:00

9501会议室

学术报告

传统原位杂交技术与RNAscope技术的应用历程

宋宁

提问和交流

12:00-13:00

9501会议室

午餐

13:00-14:00

9501会议室

技术报告

RNA原位定量技术原理及其在精准医学中的应用

李杨

提问和交流

14:00-15:00

9501会议室

技术报告

定量病理学分析技术

焦磊

提问和交流

15:00-15:30

9501会议室

技术报告

实验动物病理平台在科研中的重要作用

郝俊峰

15:30-16:00

9501会议室

技术讲座

RNAscope原位杂交实验操作总述及产品讲解

李唐平

16:00-17:00

9501会议室

操作培训

RNAscope原位杂交实验步骤1:预处理

郝俊峰

第二天 2016710

时间

地点

项目

授课内容

主讲人

主持人

9:00-12:00

实验室

操作培训

RNAscope原位杂交实验步骤2:探针杂交及信号放大

郝俊峰

12:00-13:00

小会议室

午餐

13:00-15:00

实验室

操作培训

RNAscope原位杂交实验步骤2:探针杂交及信号放大

郝俊峰

15:00-16:30

实验室

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联系人: 王敏

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