简介

表达谱测序 基因转录水平的研究是功能基因组学和医学研究的基础。数字基因表达谱（Digital Gene Expression Tag Profiling, DGE）利用新一代高通量测序技术和高性能计算分析技术，通过全面、经济、快速地检测某一物种特定组织在特定状态下的基因表达情况。数字基因表达谱已被广泛应用于基础科学研究和药物研发等领域。

应用领域

基因表达精确定量

基因表达网络构建

疾病分类研究

分析内容

1. 标准信息分析

    a)对原始数据进行去除接头、污染序列及低质量 tags 的处理

    b)测序评估（数据比对统计，测序饱和度分析，Clean tag拷贝数分布统计，Clean tag比对统计，参考基因统计）

    c)基因表达注释

    d)差异表达基因分析（差异表达基因筛选，实验重复性分析）

    e)反义链的转录分析

    f)新转录本预测（需要参考基因组序列）

    g)差异基因表达模式聚类分析

    h)GO功能富集分析

    i)Pathway显著性富集分析 j)蛋白互作网络分析（需要蛋白互作数据库中包含该物种的注释信息）

备注：部分分析需要合作老师提供详细的参考基因组/基因数据库 2. 高级信息分析 根据客户特殊要求进行个性化分析，协商确定分析内容。

样品要求

样品类型：去除蛋白并进行DNase处理后的完整RNA

样品需求：总RNA≥4 μg ，浓度≥80 ng/μl；

样品纯度：动物样本，RIN ≥ 7.0；植物样本，RIN ≥ 6.5； 28S:18S ≥1.0。

项目运转周期

标准流程的运转周期为30个工作日