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上海明烨生物科技有限公司
供应Affymetrix芯片

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产品名称: 供应Affymetrix芯片

英文名称: MingYe Gene,Inc.

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上海明烨生物科技有限公司
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 Affymetrix简介:
 
      美国Affymetrix 公司成立于1993年,是最早开发和研制基因芯片的公司,拥有对GeneChip的注册专利,在国际上享有很高的声誉。公司云集了世界资深生物学家、生物信息学家、数学家,在基因芯片行业中始终处于领先地位。其专利的寡核苷酸原位光刻合成技术将芯片上的信息储量最大化,使研究工作者们可以通过全基因组研究对遗传学与健康之间的关系进行分析。这种类型的芯片具有极高的特异性和灵敏度,重复性好,假阳性率非常低,是目前世界上最先进的基因芯片。因其具有强大的检测功能,己被广泛地应用于基因表达分析、基因分型和健康诊断等研究,大大加速了人类以及其它模式生物基因组学研究的进程。在十多年的研究开发中,其 GeneChip(TM) 技术一直以行业标准著称分子生物研究领域。
 
      Affymetrix基因芯片在理论研究领域的基因表达检测、遗传疾病机理、肿瘤的发生机理肿瘤分型中发挥着重要作用;在药物筛选、毒理学、药物基因组学等应用研究中同样发挥着重要作用。 环环相扣的设计理念令Affymetrix芯片在结果的准确性、可重复性方面独占鳌头,用Affymetrix芯片获得的实验结果在全球范围内均具可比性,最大限度的实现科研的全球一体化。

     

      下图是原位光刻合成原理:
      
 

      Affymetrix公司正是采用这种技术在光引导下原位合成寡核苷酸。具体方法如下:

(1)合成前,支持物表面经化学处理后,其表面的活性基团连接上光敏保护基团而受到保护;
(2)合成时,选择合适的光刻掩模(mask)M1保护不需聚合的部位,需要聚合部位因没有掩模而在激光点光源的照射下,除去该部位的光敏保护基团,活性基团游离出来;
(3)加入的单核苷酸(如dTMP)的亚磷酰胺活化端与该活性基团发生化学偶联反应。该单核苷酸的另一端用光敏保护基团X保护,以便下一位核苷酸的延伸;
(4)然后更换掩模(M2),在支持物上其余部位分别去保护、偶联上dCMP、dGMP和dAMP,完成第一循环(即第一位核苷酸的合成)。加一种核苷酸为一步反应,每一循环需要进行4步反应;
(5)然后将掩模旋转90o,再按上述步骤进行反应,逐个接上不同的核苷酸,直至合成所需长度的寡核苷酸链。
 
      Affymetrix免费共享生物信息学分析系统:NetAffx(TM)分析中心
 
      NetAffx(TM)分析中心是全球著名生物芯片公司Affymetrix在其网站www.affymetrix.com 上对其商品化的每一种芯片上的信息进行了全面的生物学意义注释的分析系统,它将芯片实验结果与芯片设计和注释信息关联在一起,是包含芯片最全面矩阵内容及其必要注释的生物信息学分析系统。
 
      NetAffx(TM)分析中心可以广泛地免费受用于Affymetrix产品客户和非Affymetrix客户,使用者通过简单的注册登陆系统后便可灵活地查找到目标芯片上每个特异性探针的相关生物学信息。这个系统资源向使用者提供了芯片内容的相关信息,包括探针序列和基因注释。通过此资源研究者可以很快找到基因和SNPs,然后对比和完善实验结果,最后将数据以Excel表格形式输出。
 
      此系统对Affymetrix基因芯片的应用有重要的指导意义,也为广大的基因表达分析研究者查找人、大/小鼠、犬、拟南芥、斑马鱼等等重要模式生物的基因数据及分析提供了一个强有力的工具,通过它您不仅可以得到Affymetrix公司高质量的数据库并进行多种分类分析统计,还可以由此轻松快捷地畅游全球20多个专业数据库,难怪Genbank等著名公共数据库也将其列入了它的数据信息中,这也是全球芯片行业中唯一被列入的的芯片数据库,充分证明了Affymetrix数据的可靠性及全面性。
 
      NetAffx(TM)分析中心包含公共的数据是和Affymetrix公司生成的数据。如果没有特殊的注释,公共的数据的发布每季度更新一次;Affymetrix内部的信息是随时更新的,保证其可用性。对于使用Affymetrix芯片的研究者,Affymetrix网站更是自始至终地提供强大的支持:准备使用芯片试验的科学工作者可通过该网站对目标芯片进行调研,确定具体使用的芯片种类;获得芯片结果的研究者可以在这里了解到对应于每一个探针号的探针各代表什么基因,并对大批的实验数据进行功能分类。
 
      主要功能特征:
  • 将大量的差异分析结果进行功能分类、Go 分类
  • 找出具体到某一类功能的差异表达基因
  • 从一类基因的关键词出发查出芯片上有多少此类基因及其详细信息
  • 查询具体的基因涉及到的代谢途径
  • 批量查询(一批最多达3000个)差异分析的结果,查出这些基因从核酸到蛋白的全部信息
  • 每一个查询结果都有纵深到20多个专业数据库的链接
  • 所有的查询结果记录在案并可对多种查询结果之间进行逻辑运算
  • 寻找芯片上具体基因位置的SNP位点
  • 查询为每一个基因设计的探针具体序列
  • 列出探针设计针对的具体基因序列
  • 同源性查询确定跨物种杂交的可行性