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供应亚型分析及亚型特异基因发掘

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产品名称: 供应亚型分析及亚型特异基因发掘

英文名称: MingYe Gene,Inc.

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对于定制芯片,由于基因数目相对于基因组芯片来说较少,所以可以在芯片原始数据z-score归一化后,取所有基因作芯片方向的聚类分析。对于基因总数<2000的芯片,层次聚类等聚类算法可以有效地进行。 这样可以直接将多张芯片归入不同的组,即亚型。该实例的32张芯片中,28张芯片为糖尿病II型的,4张为糖尿病I型的。
 
      计算每个基因的信息熵,信息熵越大表明分子在各张芯片中的表达是一致的。而低信息熵基因则可能是亚型特异的(只在某种亚型中特异表达)。结合基因筛选算法,我们可以将这种基因查找出来作为该种亚型的签名基因。我们找到3个II型糖尿病特异基因。