Super BSA(快速基因定位 集群分析法 近等基因池法)
产品名称: Super BSA(快速基因定位 集群分析法 近等基因池法)
英文名称: Super BSA
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北京百迈客生物科技有限公司
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选择百迈客技术平台, 就是选择科研成功之路!
将简化基因组测序同集群分析分析法(BSA)相结合,实现目标性状的快速、准确、精细定位;具有混池规模大、标记密度高、数字化定量统计基因型频率等诸多优点。
技术应用范围
应用目标:针对较大分离群体能更精细的将筛选到的关联紧密的候选区域在基因组上定位,直接对该区域进行功能基因的精细注释,获得性状相关候选基因。
已有或即将有全基因组参考序列的物种。如玉米、大豆、水稻、甘蓝、白菜、高粱、黄瓜、西瓜、马铃薯、番茄、拟南芥等物种,尤其适用于抗虫、抗病、高产等重要经济性状。
应用目标:针对较大分离群体进行目标性状分子标记开发,更准确的对分子标记与性状的关联性强弱进行排序分析,由此获得的强关联性分子标记为下游的基因精细定位工作打下坚实基础。
目前没有基因组参考序列的物种。如小麦、棉花、油菜、辣椒、鱼类、对虾、花卉、林木、烟草、药用植物等。
百迈客技术优势:
1 混池规模可达200+200
2 全基因组10,000+SNP扫描
3 定量统计基因型频率
4 第三代分子标记SNP
5 开发过程性价比高
具有一定规模的临时(如F1、F2分离群体)或永久群体(如重组自交系、近等基因系、双单倍体系、回交近交系等),性状有明显差异的父、母本材料,亲本之间的多态性不低于10%;
性状分离群体,每个群体个体要尽量多,最好不少于20个(单株),材料越多,越有利于清除背景噪音。
对于没有参考基因组的物种,亲本最好构建BAC文库,为下游的强关联标记的定位研究打下基础。为了更精确的进行功能基因的注释最好有表达谱或EST序列。
根据标记密度和标记测序深度等开发需求的不同,设计了3种方案,详细内容如下表所示。根据不同的研发需求可以定制个性化方案。
项目资源要求
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标准解决方案
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推荐解决方案
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深入解决方案
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群
体 需 求 |
亲本
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2
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2
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2
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亲本多态性
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>10%
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>10%
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>10%
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群体大小
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50+50
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100+100
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200+200
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适用群体类型
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临时群体、永久群体和自然群体
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性状分离
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需要
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需要
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需要
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区分个体
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否
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否
|
否
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测
序 标 准 |
亲本标签测序深度
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10x
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20x
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20x
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个体标签平均测序深度
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1x
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1x
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1x
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总体标签测序深度
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120x
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24x
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440x
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标签个数
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20,000
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50,000
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70,000
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