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Small RNA深度测序+信息分析

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产品名称: Small RNA深度测序+信息分析

英文名称: Small RNA deep sequencing+bioinformatics analysis

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Small RNA是生物体内一类重要的调控因子,长度范围一般在20-30bp,主要包括:microRNA,siRNA,piRNA等。它们以通过沉默和降解其靶点基因分子的方式控制基因表达,在生物体正常生长发育和疾病发生过程中起着不可忽视的调控作用。新一代测序技术提供一套全新独特的,适用于各个物种的小RNA深度鉴定与定量分析的研究平台。通过深度的测序,可以发掘、鉴定并定量出任何物种全基因组水平的小RNA图谱,推进了在功能上对小RNA研究。

 

技术优势/信息分析内容 ( 博莱明创小RNA分析报告 )
1) 数据产出统计
2) 去除低质量、污染及接头后的序列长度分布统计
3) 不同样本间的序列情况统计
4) 细胞中Non-Coding RNA的识别,包括:rRNA, tRNA, snoRNA, etc (Sanger Rfam Database)
5) Known microRNA的检测(Sanger miRbase)
6) Novel microRNA的预测
7) MicroRNA保守/同源性结构分析
8) MicroRNA表达图谱建立以及差异性检测
9) 靶基因预测,以及靶基因的功能注释,代谢途径Kegg,Gene Onlotogy(GO)
10) Endo-siRNA, 需要物种有很强的基因组和转录组数据,包括来自TE的siRNA和nature antisense transcrits(NAT)的siRNA