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布斯坦科技(北京)有限公司
基于转录组基因快速定位

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产品名称: 基于转录组基因快速定位

英文名称: RNA-seq&BSR

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    当今高通量测序技术和传统BSA法相结合在基因定位研究中的应用日益广泛,通过在全基因组范围内开发SNPs,筛选与性状紧密连锁的SNPs,从而快速进行基因定位。但是目前,由于测序成本或参考序列等限制,还无法广泛应用于非模式生物或复杂基因组物种。

而我们拥有技术创新型的生物信息学思路BSARNA-seq相结合技术(Not简化基因组,Not DNA-seq),不仅可开发出大量的SNP标记,而且结合BSA能够精细定位单性状紧密连锁的分子标记及基因(图1),并进行转录组分析,同时显著降低研究的成本,即使在非模式生物、无参考序列、复杂基因组物种中一样适用。

 

1 RNAseq and BSA技术路线

一、构建作图群体时间短:F2群体即可,大大减少构建高代纯合作图群体的时间。

二、开发连锁标记更高效:RNA-Seq数据提供BSA RNA Pool中的基因型信息,进行数据分析后即可筛选出连锁的基因(假阳性低),大大提高开发和验证连锁的多态性标记的效率。

三、转录组分析更准确成本更低:RNA Pool有效降低误差,提高结果可信度;测序直接瞄准功能基因,测序样品量和数据量小,有效降低成本和提高测序深度,且减低数据分析难度。

四、基因定位和转录组分析一站式解决:BSA&RNA-Seq既可用于基因定位又可用于转录组分析,差异表达结果可进一步辅助基因定位。

五、不仅适用于有参考序列基因组,更适合于无参考序列的复杂基因组:适合于简单和复杂基因组;适用于二倍体和多倍体物种;适用于无参考基因组的物种;如小麦、玉米、水稻和斑马鱼均适用

2 部分RNA-seq and BSA成功案例

目前,该方法已在小麦、水稻、斑马鱼等物种中成功应用。如果您有针对性状构建的遗传分离群体,如果您想在最短的时间内实现功能基因定位,就请您致电或邮件咨询我们,我们将为您提供全方位的技术服务!