功能转录组测序
产品名称： 功能转录组测序
英文名称： functional transcriptom sequencing
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产品价格： 咨询010-53223590
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功能转录组测序
——为您提供更全面、更准确的转录组信息
转录组研究是通过研究表达基因的种类、表达量和基因结构进行基因功能和结构的研究及基因组注释。通过新一代高通量测序，可以全面快速地获得某一物种特定组织或器官在某一状态下的几乎所有转录本及基因序列。
目前标准转录组文库制备是基于双链cDNA的测序，由于文库制备的问题，标准文库对转录组分析具有一定的实验偏差和限制性。单链RNA文库制备技术的发展极大地改善了标准文库的限制，成为当前科研工作者进行转录组研究的优先选择。
技术特点比较
| 传统转录组测序 | 功能转录组测序 | |
| 基本特点 | 构建标准转录组文库进行测序数据的收集和生物信息学分析 | 构建单链RNA片段文库进行测序数据的收集和“生物+信息”分析 |
| 序列完整性 | mRNA的5’端序列检测不到 | 能够检测到mRNA5转录起始位点和3polyA结构，全面准确的分析mRNA序列完整信息 |
| 基因表达量的分析 | mRNA片段化后5’端序列至3’序列检测的序列数逐渐下降，基因表达量定量较不准确 | mRNA片段化后5’端序列至3’序列检测的序列数基本一致，基因表达量定量准确 |
| 鉴定mRNA的正义反义链 | 不可以 | 可以 |
| 鉴定新转录本 | 可以 | 可以 |
| 鉴定可变剪切 | 可以 | 可以。mRNA片段化后5’端序列至3’序列检测的序列数基本一致，检测效率更强 |
“生物+信息”分析
构建单链RNA文库后进行测序数据的收集，经过基本数据处理后，根据有无参考序列，进行不同的生物信息学分析。
应用领域
- 非编码区域功能研究：Non-coding RNA研究、microRNA前体研究等；
- 转录本结构研究：UTR鉴定、Intron边界鉴定、可变剪切研究、5转录起始位点和3polyA结构的鉴定等，完善基因组的注释；
- 基因转录水平研究：基因表达与否的鉴定、基因表达量的研究等；
- 全新转录区域研究：鉴定新的转录本，进行基因组的注释；
- mRNA正义反义链研究：注释基因在基因组上的转录位置