基因组de novo分析
产品名称： 基因组de novo分析
英文名称： genome de novo sequencing
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广州瑞科基因科技有限公司
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基因组de novo测序也叫从头测序，是指不依赖任何已知基因组序列信息某个基因组序列未知的物种进行全基因组从头测序，然后运用生物信息学的技术对测序序列进行拼接组装，从而获得该物种的全基因组序列图谱。物种基因组de novo测序可在基因组水平上剖析物种的生长、发育、进化等生命特征，对物种的遗传育种与改良等科学研究起到极大的指示作用。
一般将基因组草图、框架图、精细图作如下定义：
草图定义为完成90%左右的基因组覆盖，单碱基错误率低于十万分之一的基因组组装结果。
框架图定义为完成90%左右的基因组覆盖，单碱基错误率低于十万分之一，并进行有效拼接和注释。 精细图定义为完成95%以上的基因组覆盖，进行了比较完整的功能注释和基因预测。
服务内容：
针对性项目方案设计；
样品检测、建库、测序；
标准生物信息分析；
个性化生物信息分析。
全基因组de novo测序主要分析内容：
1、测序数据基础分析与评估；
2、基因组大小分析与基因组倍性分析；
3、基因组杂合度评估；
4、基因组组装（contig and scaffold）；
5、基因预测；
6、基因功能注释；
7、基因功能聚类分析（GO分析）；
8、基因信号通路分析（KEGG分析）；
9、Genome Browser数据可视化分析；
10、比较基因组学及进化生物学分析（定制化服务）；
11、数据库的建立（定制化）。
