RNA-SEQ 分析

RNA-Seq就是指转录组的测序技术，而RNA-Seq流程是指分析测序数据的一整套相关程序的集合，在这里面分享的内容分别是：用soap软件将测序后的数据比对到参考基因或参考基因组上、对比对后的数据进行过滤、统计过滤后数据信息并计算基于的表达量，覆盖率，长度等、查看reads在参考基因组上的分布情况、计算两个样本之间基因表达量的相关性、在两个样本之间筛选差异基因、对筛选出来的差异基因进行聚类分析，对差异基因进行GO功能富集分析、对差异基因进行Pathway功能富集分析。
该流程是针对深圳华因康基因科技有限公司自身的测序特点来编写的，通过RNA-Seq流程的分析，可以了解某种样本的基因表达情况，以及主要的生物学功能。