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4D-label free定量蛋白质组学

4D-label free定量蛋白质组学

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产品名称: 4D-label free定量蛋白质组学

英文名称: 4D-label free quantitative proteomics

产品编号: AX-S045

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更新时间: 2024-03-13T11:08:02

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实验介绍

4D-label free蛋白质组学是基于timsTOF Pro离子淌度平台的新一代非标记蛋白组学技术,通过数据依赖性采集-同步累积连续碎裂(ddaPASEF)扫描模式进行差异定量蛋白质组学分析。该技术是对传统label free蛋白质组学的升级,其核心是将数据依赖采集(DDA)与同步累积连续碎裂(PASEF)相结合,外加第四维度的离子淌度分离(基于肽段的碰撞截面积CCS),提高离子利用率和鉴定精准度,以更少上样量、更快扫描速度,实现蛋白质组学在覆盖深度、灵敏度、通量方面的全面性提升。

实验流程

应用方向

药物应答、基因敲除/过表达的蛋白表达谱分析

植物、微生物生长发育与胁迫逆境生理研究

疾病生物标志物与药物作用靶点高通量分析

蛋白作用机制与特殊功能蛋白质筛选

各种物种的蛋白质组草图构建

临床微量样本最佳检测方式,如:外泌体、FFPE石蜡切片、活检穿刺组织等

数据分析

标准数据分析内容

蛋白质总鉴定数量分析

蛋定与定量结果统计、差异结果统计、火山图、聚类热图

差异蛋白质功能分析

亚细胞定位、结构域分析、GO功能分析、KEGG通路分析、PPT互作网络分析

质量控制分析

肽段离子质量偏差分布、肽段离子得分分布、蛋白质丰度比分布

高级数据分析内容

WGCNA共表达分析

获得与表型强关联的核心蛋白质

趋势聚类分析

探讨蛋白质的表达趋势模式