de novo完全测序/从头测序方案/高通量测序---物理图谱、遗传图谱、全基因组序列整体解决方案,末端测序的Fosmid文库,种质资源-分子生物学服务 -技术服务-生物在线
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de novo完全测序/从头测序方案/高通量测序---物理图谱、遗传图谱、全基因组序列整体解决方案,末端测序的Fosmid文库,种质资源

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产品名称: de novo完全测序/从头测序方案/高通量测序---物理图谱、遗传图谱、全基因组序列整体解决方案,末端测序的Fosmid文库,种质资源

英文名称: de novo sequencing

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de novo 完全测序方案
—— 物理图谱、遗传图谱、全基因组序列整体解决方案
随着新一代测序技术的发展,测序成本和测序时间大大降低,通过de novo 测序获得一个物种的全基因组序列成为快速了解该物种的一个重要途径。随着人、水稻、黄瓜、大熊猫等物种基因组测序的完成,科学家逐渐认识到仅仅获知物种全基因组序列信息对于该物种的研究还远远不够,拥有已知序列信息的种质资源库是后续分子生物学研究的重要推动力量,基于此我司推出de novo 完全测序方案,利用物理图谱、遗传图谱及全基因组序列图谱为物种研究提供完全、整体的分析解决方案。
技术特点比较

  de novo普通测序 de novo完全测序
基本特点 完全使用新一代测序平台的建库和测序,完成全基因序列图谱的拼接 新一代测序平台结合平台配套文库、Fosmid文库和分离群体提供物理图谱、遗传图谱和全基因组序列图谱
种质资源 末端测序的Fosmid文库
测序速度 利用新一代测序平台,速度快 利用新一代测序平台进行平台配套文库、Fosmid文库和分离群体的测序,速度快
测序拼接结果是否可验证 需单独构建其它可保存文库用于验证拼接拼接序列的正确性 利用已建好的Fosmid克隆测序验证拼接序列的正确性

技术路线
根据基因组重复序列等组分的复杂程度,利用新一代测序技术,结合不同长度插入片段的测序文库和Fosmid文库,整体测序深度在60×以上,以保证测序的准确性和基因组的完整性,在完成基因组测序的同时构建物理图谱;同时利用所研究物种的分离群体构建遗传图谱,结合物理图谱、全基因组测序结果对该物种基因组进行全面分析。
 
 

 “生物 + 信息”全面数据分析
测序数据经过基本数据处理后,根据不同片段文库及Fosmid文库的测序数据进行de novo 组装,最终完成全基因组序列的组装和物理图谱的构建;利用分离群体的测序数据构建遗传图谱,结合分离群体的性状进行连锁分析研究。在此基础上,对全基因序列进行基因组组分分析、基因预测及注释、与不同物种基因组的比较基因组学及进化分析,基于遗传图谱、物理图谱和基因组序列图谱及数据分析内容的基础上完成数据库网站的建立。