lncRNA高通量测序
产品名称： lncRNA高通量测序
英文名称： lncRNA-Seq
产品编号：
产品价格： 8000
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更新时间： null
使用范围： null
广州市锐博生物科技有限公司
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技术简介
长链非编码RNA(long noncoding RNA，lncRNA)是一类不编码蛋白的RNA 分子(不含rRNA)，长度在200bp 以上，起初被认为是RNA 聚合酶II 转录的副产物，不具有生物学功能;近期的研究表明lncRNA 具有保守的二级结构，可以与蛋白、DNA 和RNA 相互作用，参与多种生物学过程的调控，尤其在肿瘤当中发挥了重要的调控角色，如染色质修饰、转录激活和抑制、转录后调解以及作为miRNA 的诱导分子干扰基因的表达等。目前，lncRNA已经成为继信使RNA(mRNA)、小RNA(microRNA、piRNA、siRNA等)之后功能基因组学最火热的研究领域，但是绝大部分lncRNA的功能目前仍不清楚。
锐博生物第一时间推出长链非编码RNA测序(lncRNA seq)服务，通过基于去除核糖体RNA的建库方法以及高通量测序技术，可一次性获得样本中几乎全部RNA转录产物的序列，并通过先进的生物信息学分析，可对lncRNA进行深入的研究。LncRNA seq可以更加高效地获取lncRNA序列，且突破了常规lncRNA芯片检测技术的使用范围限制。更引人注意的是，lncRNA seq可以助力科学家对新的lncRNA进行预测及分析。
技术特点
高效性：可一次性获得样本中几乎全部的mRNA及lncRNA信息
不依赖已知信息：不局限于对已知LncRNA的定量分析，还可预测新LncRNA
高精确度： 数字化信号，可精确检测到基因家族中相似基因以及可变剪切造成的不同转录本的单碱基差异
高覆盖度： 新一代高通量测序技术的高深度覆盖，可以检测到低丰度的稀有转录本
服务流程
生物信息学分析内容
标准信息分析
1. 去除接头序列及低质量reads的处理
2. 测序质量评估
3. 核糖体RNA去除率计算
4. 参考基因组比对
5. 全基因组reads分布图谱
6. mRNA一：已知mRNA鉴定
7. mRNA二：mRNA表达量计算及样品间表达差异分析
8. mRNA三：差异基因KEGG生物通路富集分析
9. mRNA四：差异基因GO功能富集分析
10. mRNA五：预测新转录本
11. mRNA六：新转录本的蛋白结构域、ORF(开放阅读框)及编码潜能鉴定
12. lncRNA一：已知lncRNA鉴定
13. lncRNA二：计算已知lncRNA表达量及样品间lncRNA表达差异分析
14. lncRNA三：预测新lncRNA
15. lncRNA四：计算新lncRNA表达量及样品间新lncRNA表达差异分析
16. lncRNA五：新lncRNA二级结构预测
定制化信息分析
1. time series差异表达
2. 基因融合
3. RNA编辑
4. 共表达网络构建(样品数大于10)
5. SNP分析和eQTL分析
6. 基因结构优化及优化基因的表达值计算
7. 蛋白互作网络分析
8. 样品间可变剪切和新转录本的比较
9. lncRNA的功能分析(五个lncRNA)
10.组间差异分析