芯片的设计源于基因芯片的设计方法和生物分子反应的原理。在一块微小的固体表面上结合抗体或抗原、DNA、酶、受体、单链抗体(scFV)L2：，作为摄取抗原或抗体、DNA结合蛋白、底物、配体、多样抗原等特异基质，再加上经化学修饰的二抗作为检测信号或直接检出，信号检测器为激光共聚焦扫描仪、荧光透射扫描仪、质谱仪等，检测到芯片上酌光或化学信号后传输给计算机通过软件包进行统计处理，可以获得有关蛋白表达的大量信息。2．2 色谱学或层析原理 这种芯片设计根据层析技术，结合质谱发展而来。设计芯片为可结合蛋白的固体点表面，如在固体表面涂渍疏水性碳水化合物(HydbDph6ZcSudhce，H4)、亲水表面(NoRyLBlPhase，NP)、特异性结合表面(keactivatedSudMe，赐)、强阴离子交换表面(ShDng AnioH Exchan8e，SAx)、弱阳离子交换表面(Weak Ca60H Exahange，WCx)、固定金属亲和表面(iMlob勋朋d MetalASniqr C叩ture，IMAC)等表面涂渍物可以非特异或特异性结合蛋白质，结合能量吸收分子(EnerBdbsorb matdx，EAM)后，在真空管中用激光轰击，蛋白质在吸收能量后脱离芯片表面，由于其中加有一个正电荷，在电场中向阴极飞去，分子量大的飞行时间长，分子量小的飞行时间短，以此标记蛋白质的分子量，绘出蛋白质的图谱，该项技术总称为表面增强激光解析及电离飞行时间质谱SEUI—TOF—MS(Sudace Ehanced比er DesorptioVIom。z此oH—time of n炒t—Mass SpechDme卸)[3j，由于质谱检测的灵敏度高，可把传统方法检测不到的蛋白和多肢检测出来，因此对肿瘤标记物的筛选意义重大。该项技术如果联合检测前的样品分段萃取分离和检测后的专用蛋白图谱统计软件分析，可以快速的找出新的肿瘤标记物并获得尽可能多的蛋白组学信息。其优点是方便、快速、灵敏度高、蛋白信息量多。