磷酸化蛋白质组
产品名称: 磷酸化蛋白质组
英文名称: Phosphorylation proteomics
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翻译后修饰是蛋白质调节功能的重要方式,在生命现象的许多关键调节机制中,蛋白质的磷酸化是重要的翻译后修饰,它与信号传导,细胞周期,生长发育以及癌症机理等诸多生物学问题有密切关系。因此,对于蛋白质磷酸化的研究对阐明蛋白质的功能具有重要意义。武汉华美生物蛋白质组平台根据客户需求,可提供磷酸化蛋白质组全谱鉴定技术服务。
磷酸化蛋白质组全谱鉴定以组织、细胞等较为复杂样本的为研究对象,目的在于鉴定样品中发生磷酸化的蛋白质以及相应的位点。对蛋白样本进行酶解,TiO2或IMAC富集磷酸化肽段,5600-plus质谱检测,利用得到的质谱谱图与相应数据库搜索比较,从而得到肽段序列结果,同时通过生物信息软件计算出磷酸化位点。
定量方面,磷酸化蛋白质常常选择iTRAQ定量或SWATH定量方法。
图:TiO2或者IMAC富集磷酸化流程图。
我公司的技术特点
l 高效率、高准确性:单次实验可鉴定上千种磷酸化位点,快速构建某种细胞或者组织的磷酸化蛋白修饰谱。精确定位到单个氨基酸位点的磷酸化修饰。
l 碎裂模式选择:提供目前性能最佳的TOF-CID碎裂模式,提高磷酸化位点鉴定准确性。
l 定量准确:该方法可以较为准确的发现多个样品间同一蛋白质磷酸化位点的差异;
信息分析内容
l 磷酸化位点鉴定,依据位点打分过滤,可靠性评估;
l 磷酸化肽段和磷酸化蛋白质鉴定;
l 磷酸化位点、磷酸化肽段差异表达分析;
l 磷酸化蛋白质GO 功能注释、Pathway代谢通路注释;
l 差异磷酸化蛋白GO、Pathway功能富集分析。