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奥明(杭州)基因科技有限公司
ATAC-seq

ATAC-seq

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产品名称: ATAC-seq

英文名称: ATAC-seq

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产品价格: 8200

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技术简介(Technical Introduction)

    ATAC-seq是通过使用高通量测序对转座酶可接近性核染色质区域进行分析(Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high throughput sequencing)的一种创新表观遗传学研究技术。该技术通过转座酶对某种特定时空下开放的核染色质区域进行切割,进而获得在该特定时空下基因组中所有活跃转录的调控序列。
    真核细胞通过将基因组DNA与组蛋白进行不同层次的折叠组装成染色质,这些精密组装信息在基因转录调控中起决定性作用。染色质区域的可接近性是特异性反式作用因子和顺式调控元件相互作用的前提,基因表达的异常或者染色质调控因子的改变都将对细胞的命运产生深远的影响,进而导致各种疾病的发生、发展。目前该技术已被广泛应用于转录调控序列的鉴定。ATAC-seq技术可运用于所有真核细胞重编程的研究,在医学领域是重大疾病发病机制、药物作用机制、新药研发和生物标志物功能等研究的新一代有利工具。

技术路线(Workflow

ATAC-seq技术服务步骤


ATAC-seq数据分析步骤


技术参数(Technical Parameters)

   
 产品服务  测序平台     参数指标    周期
 ATAC-seq Hiseq PE150 30M reads (total reads) 45天

   

样本要求(Sample Requirements)

1. 制备至少含有1×105个细胞的细胞沉淀(推荐2×106个细胞),并在样品表上注明总细胞数量;
2. 用磷酸缓冲液(PBS)将离心细胞沉淀洗涤至少一次(推荐三次),并将细胞沉淀置于1mL小瓶或管中;
3. 加入OmiFrost ATAC-seq专用冻存液将细胞沉淀物冻存;
4. 样品保存期间切忌反复冻融;请用干冰运输样品到本平台,不超过48 h。