细菌全基因组测序及生物信息学分析
产品名称: 细菌全基因组测序及生物信息学分析
英文名称: bacterial de novo sequencing
产品编号:
产品价格: 5000
产品产地: null
品牌商标: null
更新时间: null
使用范围: null
北京诺赛基因组研究中心有限公司
- 联系人 :
- 地址 : 北京市经济技术开发区永昌北路3号707
- 邮编 : 100176
- 所在区域 : 北京
- 电话 : 010-678*3332-841 点击查看
- 传真 : 点击查看
- 邮箱 : janezhousgm@163.com
技术简介:
从头测序即 de novo 测序,不需要任何参考序列资料即可对某个物种进行测序,用生物信息学分析方法进行拼接、组装,从而获得该物种的基因组序列图谱。利用全基因组从头测序技术,可以获得动物、植物、细菌、真菌的全基因组序列,从而推进该物种的研究。
生物信息分析:
1. 原始序列预处理和拼装;
2. 填补Gap获取精细图或完成图;
3. 基因组组分分析,包括各类ncRNA、重复序列和转座子等;
4. 基因结构预测及功能注释;
5. 蛋白结构域注释;
6. 生化反应通路图(PATHWAY)映射;
7. 基因本体论(GO)注释;
8. 特异序列、特异功能蛋白等的预测。
送样要求:
样品 | 要求 |
DNA | 小片段文库: ≥5ug;2kb~5kb≥40ug;10kb≥60ug |
浓度 | 小片段文库: ≥50ng/ul;2kb~5kb≥150ng/ul;10kb150ng/ul |
纯度 | OD 260/280 =1.8~2.0 ;无蛋白及RNA 污染 |