引言：为什么需要定量蛋白质组学？

在现代生命科学研究中，仅仅知道蛋白质的存在已远远不够。科学家更关注的是：这些蛋白表达多少？变化趋势如何？是否参与疾病发生？这就需要定量蛋白质组学（Quantitative Proteomics）技术的加持。定量蛋白质组学不仅能够全面识别样本中的蛋白质种类，更能精准测量它们的表达水平，是解析信号通路、发现生物标志物、研究疾病机制的关键利器。

一、定量蛋白质组学技术三大路线

1、标记法（Labeling-based Quantification）

TMT（Tandem Mass Tags）/iTRAQ等同位素标记技术，通过在蛋白或肽段上引入标签，实现多个样本的相对定量分析。

优势：

• 多重样本并行分析（常见6-16通道）
• 实验重复性高、数据一致性强

百泰派克生物科技在TMT/iTRAQ平台上优化了样本前处理与归一化流程，显著提升低丰度蛋白的检测率。

2、无标记法（Label-free Quantification）

通过MS信号强度（MS1）或肽段计数进行相对定量，不依赖于外源标签。

优势：

• 无需额外标记，适合样本数量多或来源受限的研究
• 灵活适配复杂样本（如组织、血清、细胞等）

百泰派克生物科技结合高分辨率Orbitrap质谱和先进算法，实现低CV值的LFQ定量，适配大队列临床样本分析。

3、绝对定量（Absolute Quantification）

例如AQUA、PRM、MRM等技术，通过合成同位素内标对目标蛋白进行精确定量。

优势：

• 获得准确的蛋白浓度值（ng/mL级）
• 适合生物标志物验证、药效评价、质量控制等环节

在靶向蛋白验证方面，百泰派克提供一站式PRM方法开发与数据解读服务，助力临床转化研究。

二、定量蛋白质组学的核心应用场景

1、差异表达分析

通过比较不同组（如疾病组与正常组）的蛋白表达差异，揭示潜在的发病机制与调控网络。

2、生物标志物筛选与验证

配合PRM/MRM等技术，可将筛选得到的候选蛋白进一步精确定量，用于早期诊断与靶点开发。

3、药物作用机制研究

监测药物干预前后的蛋白表达变化，解析其对代谢通路、信号网络的调控效应。

4、多组学联合分析

结合转录组、代谢组等，构建系统生物学视角下的疾病模型，推动精准医学研究。

百泰派克已完成数百例多组学联合项目，涵盖肿瘤、自身免疫、代谢性疾病等多个领域。

三、定量蛋白质组学技术发展趋势与挑战

1、高通量与高灵敏的需求不断提升

随着单细胞、类器官等新型模型兴起，对定量技术提出更高要求。

2、数据分析成为瓶颈

复杂的大数据需要强大的生信分析能力与AI算法辅助。百泰派克配备专业的生信团队，构建标准化数据处理与可视化报告系统，提升结果可解释性。

3、标准化与可重复性成为热点

定量实验流程的标准化、QC体系的建立，将直接影响科研成果的可信度与临床可转化性。

定量蛋白质组学技术正不断推动生物医学研究向更高维度迈进。从基础机制探索，到临床标志物验证，再到药物作用机制解析，它无疑是贯穿“从发现到应用”的核心桥梁。百泰派克生物科技深耕质谱平台十余年，依托高端仪器与成熟的定量流程，为科研与产业客户提供高质量、可发表的定量蛋白组服务。我们致力于让每一份样本数据，都为科研突破和产业转化提供真实而有力的证据。

百泰派克生物科技特色项目

一、蛋白测序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析，提供基于质谱的蛋白测序分析服务，包括对蛋白质的氨基酸组成分析，N端测序，C端测序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质，提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务，对蛋白序列进行分析。

※服务优势：

1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;

3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug，即可完成检测;

6.测序不受N端封闭，PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

二、蛋白质组学

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务，助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

※服务优势：

1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析，发现新的生物标记物;

2.体内体外多种蛋白质标记方法，适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

3.质谱分析灵敏度高，实验结果重复度高;

4.可检测较低丰度蛋白，线性范围广;

5.专业生物信息学分析，分析更系统准确。

三、单细胞质谱流式技术分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析，采用金属元素标记物（通常是金属元素标记的特异抗体）标记细胞表面和内部的分子，然后用流式细胞原理分离单个细胞，再用电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）分析单个细胞的原子质量谱，最后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

※服务优势：

1.技术先进，填补技术空白

采用金属标记抗体技术，避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征，百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。

2.分析数量大，成本较低

单细胞RNAseq受成本等因素限制，所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右，而流式质谱技术一次（单样本）就可分析至少10^5的细胞，实现了数量级的提高，且成本不高于单细胞RNAseq。

3.应用前景大

①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化，在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景；

②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外，质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰；

③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析，可从最小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究，旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案，深入挖掘未知的靶标。

五、生物药物表征

百泰派克基于高分辨率质谱技术，MALDI TOF，高效色谱分离技术，提供一系列完善的生物药物分析方案，从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析，到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务，帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

百泰派克生物科技七大检测平台

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物质谱多组学优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则，通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证，建立了完备的质量体系，数据冷热/异地备份，设备定期计量/期间核查，软件审计追踪，为客户提供一体化解决方案和技术服务，支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

1.公司采用ISO9001质量控制体系，专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务；

2.获国家CNAS实验室认可，为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务；

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