WNT信号通路PCR芯片可用于研究与WNT介导的信号转导相关的84个基因的表达，同时测定实验组样本中经典的WNT/β-catenin信号通路活性是被激活，抑制还是没有变化。WNT家族的分泌型生长因子不仅参与细胞功能和极化发育过程的调控，同样对普通的细胞生命活动例如动态平衡和细胞周期也起到调控作用。在细胞中有19个WNT的配体，与Frizzled (FZD)家族受体和辅助受体LRP5和LRP6相结合。WNT信号传导包含了3个通路：经典通路和平面细胞极性通路(PCP)，钙离子依赖型通路两个非经典通路。其中经典WNT通路已经得到了良好的研究，是通过ß-catenin传导信号来调节细胞周期，细胞生长和增殖。PCP通路则调节细胞骨架的动态变化以及细胞运动，WNT/Ca2+通路能够促进NFAT基因的转录，都是与经典的ß-catenin信号途径相独立的。该芯片涵盖了以上三个WNT通路中的配体、受体以及其它的下游信号分子基因，除此之外也包含了WNT信号传导的上游调节因子和下游靶标基因。该芯片同时包含了16个通过实验验证得到的显著标志基因，通过分级运算程序可计算得到活性分值。每块芯片上都设定了一组对照通过ΔΔCT方法分别对反转效率，基因组DNA含量和PCR效率进行评估。通过实时定量PCR方法，研究者即能够利用该芯片简单可靠地测定经典WNT/β-catenin信号通路活性并同时检测WNT介导的信号转导相关基因的表达。
WNT Signaling Pathways: Canonical: APC, AXIN1, AXIN2, CSNK1A1, CTBP1, CTNNB1, CTNNBIP1 (ICAT), DKK1, DKK3, DVL1, DVL2, EP300, FRAT1, FZD1, FZD2, FZD3, FZD4, FZD5, FZD6, FZD7, FZD8, FZD9, GSK3B, LEF1, LRP5, LRP6, NKD1, PORCN, RUVBL1, SFRP1, SFRP4, SKP2, SOX17, TCF7, TCF7L1, WIF1, WNT1, WNT10A, WNT2, WNT2B, WNT3, WNT3A, WNT4, WNT6, WNT7A, WNT7B, WNT8A. Planar Cell Polarity (PCP): DAAM1, DVL1, DVL2, MAPK8 (JNK1), NKD1, PRICKLE1, RHOA, VANGL2, WNT9A. WNT/Ca+2: FZD2, NFATC1, WNT1, WNT10A, WNT11, WNT2, WNT2B, WNT3, WNT3A, WNT4, WNT5A, WNT5B, WNT6, WNT7A, WNT7B, WNT8A, WNT9A. WNT Signaling Negative Regulation: APC, AXIN1, AXIN2, BTRC (bTrCP), CCND1, CTBP1, CTNNBIP1 (ICAT), DKK1, DKK3, FBXW11, FRZB (FRP-3), KREMEN1, LRP6, NLK, NKD1, SFRP1, SFRP4, SOX17, WIF1. WNT Signaling Target Genes: AXIN2, BTRC (bTrCP), CCND1, CCND2, DAB2, FOSL1 (FRA-1), JUN, MMP7, MYC, PITX2, PPARD, WISP1. Developmental Processes: Cell Fate: CTNNB1, DKK1, WNT1, WNT3, WNT3A. Tissue Polarity: AXIN2, FZD2, FZD3, FZD5, FZD6, VANGL2. Cell Growth & Proliferation: APC, CCND1, CCND2, CTBP1, CTNNB1, CTNNBIP1 (ICAT), DAB2, EP300, FGF4, FOSL1, FZD3, JUN, LRP5, MMP7, MYC, PPARD, WISP1, WNT3A. Cell Migration: APC, DKK1, LRP5, LRP6, RHOA, WNT1. Cell Cycle: APC, BTRC (bTrCP), CCND1, CCND2, CTNNB1, EP300, FOSL1, JUN, MYC, RHOA, RUVBL1, TCF7L1. Cellular Homeostasis: APC, FZD2, JUN, MYC. Pathway Activity Signature Genes: BOD1, CALM1, CCND1, CCND2, CHSY1, CXADR, CYP4V2, HSPA12A, LEF1, MT1A, MTFP1, MTSS1, MYC, NAV2, PRMT6, SKP2.