Small RNA 测序
产品名称: Small RNA 测序
英文名称: Small RNA-seq
产品编号:
产品价格: 2000
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北京诺赛基因组研究中心有限公司
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技术简介:
Small RNA是一类重要的体内调节分子,主要包括miRNA、piRNA和siRNA。它的功能主要是诱导基因沉默,参与基因转录后调控,从而调节细胞生长、分化,以及个体发育、生殖等重要生物学过程。用高通量测序技术,一次性获得单碱基分辨率的数百万条Small RNA序列信息,依托强大的生物信息分析平台,鉴定已知小RNA,并预测新的小RNA及其靶标基因。
生物信息分析
1. 与miRNA 数据库(miRBase)进行比对
2. 鉴定与重复序列相关的RNA
3. 对小RNA 序列进行注释分类
4. 差异表达分析和miRNA 表达谱构建
5. 小RNA 序列聚类分析
6. 通过生物信息学方法预测新的候选miRNAs
7. 将小RNA 定位到基因组上探索其在染色体上的分布特征
技术优势:
1、不依赖已知信息:可对任意物种、任意大小、已知或未知的小RNA进行序列测定,可以鉴定已知miRNA,也可预测新的miRNA。
2、 分辨率高:可检测单个碱基差异,区分相同家族或序列相似性极高的小RNA。
3、 通量高:可精确检测出几个到数十万个拷贝的小RNA。
送样要求:
样品 | 要求 |
RNA | 去蛋白并进行DNase 处理后的完整总RNA |
组织 | 液氮处理,植物 ≥20ug ;动物 ≥10ug ;也可液氮研磨成粉末后加入Trizol (50-100mg 加入1ml Trizol );全血样品需新鲜样品时加入3 倍体积Trizol LS ,以防止RNA 降解。 |
浓度 | ≥200ng/ul |
纯度 | OD 260/280 =1.8~2.2 ;RIN ≥8 |