甲基化特异性检测(MSP/qMSP/BSP)
产品名称: 甲基化特异性检测(MSP/qMSP/BSP)
英文名称: MSP/qMSP/BSP
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使用美国AB公司的9700 PCR System为主的多种PCR装置。 |
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一,原理与应用
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甲基化是在DNA甲基转移酶(DNA Methyltransferase, DNMT)催化作用下, 利用 S-腺苷甲硫氨酸(S-adenosylmethionine, SAM)提供甲基,在CpG二核苷酸中胞嘧 啶嘧啶环的五号碳原子上加上甲基的共价修饰过程。DNA甲基化修饰现象广泛存在于 多种有机体中,是最早发现的修饰途径之一,是表观遗传学(Epigenetics)的重要组 成部分。大量研究表明,DNA甲基化不改变DNA的一级结构,但是能引起染色质结构、 DNA 构象、DNA稳定性及DNA与蛋白质相互作用方式的改变,从而在基因的表达及 其调控、DNA的复制、细胞的生长发育、X染色体失活、衰老以及许多人类疾病(如发 育畸形、癌症、心血管疾病、糖尿病和神经心理失调等)发生过程中发挥重要作用。 |
DNA的甲基化主要形成5-甲基胞嘧啶和少量的N6- 甲基腺嘌呤及7-甲基鸟嘌呤。 在高等生物中,5-甲基胞嘧啶多发于CpG二核苷酸序列中,基因组中60%-90%的 CpG是甲基化的。在甲基转移酶(DNMT)的催化作用下,利用S-腺苷甲硫氨酸(SAM) 提供的甲基,使CpG二核苷酸序列中的胞嘧啶转变为5-甲基胞嘧啶。由于甲基化胞嘧 啶极易在进化中丢失,高等真核生物中CpG序列远远低于其理论值,但在基因组的某 些区域中,通常是基因的启动子和第一外显子区,CpG序列密度很高,可以达均值 的5倍以上,成为鸟嘌呤和胞嘧啶的富集区,形成所谓的CpG岛。哺乳类基因组中约 存在4万个CpG岛,大多位于转录单元的5’区。CpG岛的高甲基化是肿瘤中存在的普 遍现象,而启动子CpG 岛的高甲基化是除突变和缺失外肿瘤中抑癌基因失活的第三种 机制。因此,基因启动子甲基化检测在临床诊断、药物敏感性检测等方面具有很高的 应用价值。 |
二, 服务项目 |
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三, 检测方法 |
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亚硫酸盐修饰克隆测序法,巢式PCR法,荧光定量PCR法 |
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四, Real Time PCR装置 |
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使用美国ABI公司的9700 PCR仪和Step-one PLUS System为主的PCR装置。 |
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五, 服务项目说明
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1, 亚硫酸盐测序法 (bisulfite sequencing PCR, BSP) |
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先抽提基因组DNA,再进行亚硫酸盐修饰,甲基化PCR后装克隆,通过最后对PCR产 物进行克隆测序,可以得到目的片段中每个CG位点的甲基化情况,这种方法更加准确,所以 目前BSP法受到更多研究者的青睐! 最后通过对测序结果分析, 可以得到如下数据: 1. 测序序列与目的序列的相似度(%) 2. C-T转化效率(%) 3. 目的序列中每个CG的甲基化情况(点状图) 4. 目的序列中每个CG的甲基化比例(%)
点状图
柱状图(百分比)
序列比对 |
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2,甲基化特异性PCR (methylation-specific PCR,MSP) |
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甲基化特异性PCR(Methylmion Specific PCR,MSP)及其改进方法是检测基因甲基化的经典方法. MSP法的原理是首先用亚硫酸氢钠修饰处理基因组DNA,所有未发生甲基化的胞嘧啶都被转化为尿嘧啶,而 甲基化的胞嘧啶则不变。然后设计针对甲基化和非甲基化序列的引物并进行聚合酶链反应(PCR)扩增,最后 通过琼脂糖凝胶电泳分析,确定与引物互补的DNA序列的甲基化状态。
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3,QMSP分析 |
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QMSP采用荧光定量的方法,可确切定量出甲基化的比例。详情请电联我们的技术服务人员。 |
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4,服务要求 |
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1. 如果您需要进行此项服务,请电话联系我们公司或发送E-mail给我们。 数为106以 上,动物组织为100 mg以上。 |