分子对接
产品名称： 分子对接
英文名称： molecular docking
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武汉合研生物医药科技有限公司
- 联系人 :
- 地址 : 武汉市东湖新技术开发区高新大道666号光谷生物城C1栋
- 邮编 :
- 所在区域 : 湖北
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- 邮箱 : huangmingwei@conradbio.com
公司介绍
武汉合研生物医药科技有限公司坐落于光谷生物城，是一家专注于提供新药发现阶段的技术服务，以中小微新药研发企业为服务主体的创新型公司。合研生物拥有一支训练有素的药物研发技术团队，提供的服务覆盖虚拟筛选、酶学靶点筛选、抗肿瘤药物活性评价、细胞功能学检测、药理病理学服务等各项技术，同时也提供可购买的商业化合物库。我们的技术团队在分子生物学、细胞生物学、结构生物学等领域具有丰富的经验，通过酶水平、细胞水平测定等技术平台帮助客户进行化合物筛选及化合物特性、作用机制等研究。合研生物以高效、高性价比的专业服务帮助客户更快地达到目标，帮助客户推进药物发现的进程。
我们的优势
合研生物可以利用基于结构的药物设计方法，对可购买化合物、天然产物等数据库进行虚拟筛选，并获得潜在活性的化合物列表供进一步活性实验确证。面向制药企业和科研院所，可提供一站式的早期药物研发服务，包括虚拟药物筛选、先导优化、靶标预测、动力学模拟等，涉及化学药、生物药、中药等多种新药类型，为您提供优质的药物发现服务。
- 计算机辅助药物设计
1. 基于结构的药物设计（Structure-based Drug Design, SBDD）
a) 分子对接（Molecular Docking）
b) 从头设计（de novo）
c) 药效团模型（pharmacophore）
2. 蛋白结构的同源模建（Homology Modeling）
3. 动力学模拟（Molecular Dynamics）
4. 基于配基的药物设计（Fragment-based Drug Design, FBDD）
a) 定量构效关系分析（QSAR）
b) 机器学习模型（Machine Learning）
c) 构象分析（Conformational Analysis）
5. 先导化合物优化（Lead Optimization）
a) 骨架跃迁（Scaffold Hopping）
b) 生物电子等排体（Bioisostere）
c) 分子相似性分析（Molecular Similarity Analysis）
d) 成药性分析（Drug Profiler）
理化性质（Physical and Chemical Properties）
ADME性质（ADME Property）
安全性（Safety Profiler）
6. 多靶标药物设计（Multi-target Drug Design）
- 反向靶标预测
反向对接（Reverse Docking）
反向药效团模型搜索（Pharmacophore Matching）
配体分子相似性分析（Ligand Similarity Analysis）
化合物-靶标网络（Compound-Target Network Plot）
靶标作用通路富集分析（Pathway Enrichment Analysis）
- 基于靶标的合理药物设计
* 基于配体的合理药物设计
如果没有任何靶标结构相关的信息可以利用，可以根据已知的活性分子，根据相似性原理，开展定量构效关系分析、药效团模型构建、假想受体模型等研究，或进行先导化合物的结构优化，快速发现 me too, me better的化合物。
* ADME/T特性的理论评测
可通过理论方法预测、分析客户所提供的苗头或先导化合物的吸收、分布、代谢、排泄以及毒性(ADME/T)特性，以帮助提高这些化合物的成药性。这些理论预测模型均基于大数据分析获得，既包括大量的商业模型，也包括基于独有技术开发的模型。
* 表型活性的靶标预测
对已经经过表型活性确认的分子，例如抗肿瘤、抗菌药物，通过反向分子对接、药效团搜索和机器学习算法推测该活性分子的潜在靶标，并进一步快速验证靶标的正确性。对分离或者合成获得的新颖化合物结构，可以通过上述技术，预测该化合物的潜在活性，实现靶标发现，提升化合物价值。
服务流程：
客户提出需求-> 公司提供初步方案->双方协商方案细节与定价->公司提供药物设计结果->客户反馈->后续跟进服务
