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北京美科美生物技术开发有限公司
生物芯片数据的分析

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芯片类型 服务描述

服务内容

cDNA表达谱基因芯片 为Affymetrix、Aligent、illumina及国内诸多品牌的表达谱芯片提供专业数据分析。 提供包括聚类分析、基因功能分类注释(GO分类)、代谢通路分析(pathway分析)、转录因子(TF)分析、Data-driven Network分析、Knowledge-driven Network分析、疾病的分型及(疾病)预测模型的构建等诸多项数据分析项目. 
蛋白质芯片 基于SELDI-TOF-MS平台和MALDI-TOF-MS平台,为客户提供包括实验设计、实验操作、数据分析及实验验证在内的全程服务解决方案.

提供原始聚类分析、样本的主成分分析(PCA)、分组差异peak的筛选、疾病的分型、疾病预测模型的构建及差异蛋白鉴定. 

MicroRNA芯片 为Exiqon、SuperArray等诸多类型的MicroRNA芯片提供数据分析 提供聚类分析、MicroRNA的功能、基因座分类、靶基因预测、靶基因预测、调控网络分析等多项服务. 
Exon芯片 为各种平台的Exon平台提供数据分析 提供包括Exon水平表达值的获取、Gene水平表达值的获取、可变剪切体的寻找及后续分析.  
SNP芯片 Illumina,Affymetrix等不同平台的SNP

分析项目:SNP注释、基于模式识别的SNP挖掘、诊断模型建立、不同SNP平台整合分析、SNP芯片与表达谱芯片,aCGH等其他高通量数据整合及后期的实验验证

甲基化(CpG)芯片 各种平台的甲基化芯片 项目包括分析探针水平数据的平滑处理以及差异CpG 岛的筛选、CpG 的基因注释并寻找CpG 岛对应的基因启动子、转录因子预测分析、甲基化显著基因的功能分析、甲基化与基因表达的相关性分析,及最后的实验验证,测序引物设计等
质谱(MS)实验 ESI,MALDI等各种平台的质谱数据 分析项目包括不同的分组对应进行差异蛋白/峰的筛选,及其应基因的搜索,并进一步的进行gene ontology分类,pathway通路分析等。