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【基因编辑】服务之一:CRISPR/Cas9基因敲除
简介
CRISPR/Cas(Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats/Cas)系统是目前被广泛运用的基因编辑系统,其原理是由CRISPR转录产生的gRNA介导Cas核酸酶靶向目标序列,对序列进行切割。其中最常用的是靶向DNA的CRISPR/Cas9系统,此系统是由II类CRISPR/Cas系统改造而来,能够在植物、细菌、酵母、鱼类及哺乳动物等多种细胞中,进行有效的靶向编辑,具有操作简易、效率高、以及作用靶位点多等优势。
CRISPR/Cas9系统中sgRNA(small guide RNA)识别并结合目标基因的靶向序列,引导Cas9对结合位点进行剪切,产生DNA双链断裂(double-strand break, DSB),机体自身通过非同源重组(non-homologous end joining,NHEJ)的方式修复DSB,参与修复的蛋白经常会在DNA末端插入或删除几个碱基,修复后的基因由于产生突变而导致功能丧失,从而实现机体内的基因敲除(Gene Knockout)。
其中Cas9可根据不同菌属来源及大小进行分类,目前得到广泛应用的有SpCas9和SaCas9,SpCas9来源于化脓性链球菌(S.pyogenes)的Cas9核酸酶,由1368个氨基酸组成,可识别的PAM序列为NGG ,由于构建载体载量过大,因此所选择的病毒载体有限,通常构建在慢病毒载体上;SaCas9是来源于金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)的Cas9核酸酶,由1053个氨基酸组成,可识别的PAM序列为NNGRRT,比SpCas9小25%,能够进行AAV病毒的包装,适用范围更广。
CRISPR/Cas9系统介导的基因编辑(Wiles M V et al. Mammalian Genome, 2015)
非同源重组修复DSB(Wiles M V et al. Mammalian Genome, 2015)
应用
CRISPR/Cas9基因敲除细胞系建立
CRISPR/Cas9基因敲除建立动物疾病模型
技术优势
- 操作简易:仅需Cas9核酸酶和sgRNA即可对目标基因靶位点进行切割;
- 效率高:在基因组水平上编辑目标基因,高度模拟目标模型,可精确编辑基因组;
- 作用靶位点多:可实现多个靶基因位点及多个基因的同时敲除;
- 提供多种基因编辑病毒工具:AAV、LV;
- 提供 BSL-1 和 BSL-2 病毒注射及实验操作平台;
- 全面的实验技术支持。
服务内容
- sgRNA的设计;
- 细胞内sgRNA剪切活性筛选;
- 敲除载体的构建;
- 依据所要编辑的细胞选择Cas9和sgRNA不同导入方式:
b、 脂质体难转染细胞:使用质粒系统电转化、慢病毒或腺相关病毒感染(Cas9和sgRNA);
- 筛选基因敲除单克隆细胞系。
服务流程
客户提供
1、目的基因基因序列(序列/ID)以及物种来源;
2、需介导基因敲除的细胞(可选);
3、病毒类型选择以及要求;
4、血清型选择。
服务信息及最终交付内容、产品
流程分布 | 周期(工作日) | 交付内容 | 交付产品 |
sgRNA序列的设计 | 2~4周 | sgRNA设计分析报告 | - |
sgRNA的活性筛选 | 获得有活性的sgRNA及筛选报告 | ||
基因敲除质粒的构建 | 1周 | 基因敲除质粒报告 | 基因敲除质粒 |
病毒包装 | 3周 | 病毒包装报告 | 高纯度病毒 |
单克隆细胞分选报告 | 8周 | 单克隆细胞分选及检测结果报告 | 基因敲除单克隆细胞系 |
声明:枢密科技提供的所有基因编辑服务及该服务的后续研究,仅适用在国家法律和伦理规范的范围内实施。禁止用于任何人体或临床实验的研究;禁止用于对人类生殖体系进行基因修饰的研究;禁止将基因修饰的其他动物胚胎及生殖细胞植入人体。客户如违反相关法律规定,本公司不承担任何法律责任。
案例展示
HaoyiWang等人研究发现,CRISPR / Cas介导的基因编辑允许高效地同时破坏小鼠胚胎干(ES)细胞中的五个基因(Tet1,2,3,Sry,Uty-8等位基因),通过NHEJ引入多个随机indel的靶向突变。将靶向Tet1和Tet2的Cas9 mRNA和sgRNA共注射到受精卵中,在两种基因中产生具有双等位基因突变的小鼠,效率为80%。CRISPR / Cas系统允许一步产生携带多个基因突变的动物,这种方法将大大加速功能冗余基因和上位基因相互作用的体内研究。
小鼠胚胎干细胞的多基因敲除(Wang H et al. Cell, 2013)
小鼠和小鼠胚胎干细胞的多基因编辑(Wang H et al. Cell, 2013)
参考文献
- Wiles M V , Qin W , Cheng A W , et al. CRISPR–Cas9-mediated genome editing and guide RNA design[J]. Mammalian Genome, 2015, 26(9-10).
- Wang H , Yang H , Shivalila C , et al. One-Step Generation of Mice Carrying Mutations in Multiple Genes by CRISPR/Cas-Mediated Genome Engineering[J]. Cell, 2013, 153(4):910-918.