三维图像分析测量软件
产品名称: 三维图像分析测量软件
英文名称:
产品编号: imaris
产品价格: 0
产品产地: 瑞士
品牌商标: Bitplane
更新时间: null
使用范围: null
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Imaris介绍
Bitplane 的Imaris 系列模块是生命科学领域中的显微图像分析中,多维图像处理和分析的主导软件。包括:
Imaris, Imaris MeasurementPro, Imaris Track,ImarisColoc,FilamentTracer,ImarisInPress,ImarisXT,AutoAligner和AutoDeblur。
一、Imaris:
Imaris 是BITPLANE 软件系列模块中的基本平台。
特点:
1、Imaris 专为生命科学研究设计界面。提供一个任何尺寸图像的3 维、多通道和时间序列(4 维)图像处理和显示。
2、在光学显微镜领域,特殊的装载程序可以打开各个著名厂家的共聚焦和宽视场3D 和4D 激光共聚焦显微镜和其他高端显微镜图像系统图像格式,自动识别各个采集图像软件获得的采集数据。另外,也提供了最先进的为Tiff系列文件的装载程序,用户可以定义通道序列、时间点序列和Z 平面序列配置。所有模块可以运行在Windows 2000 ,Windows XP , Windows Vista 和 Mac (32 and 64bit) 。
3、结合速度,精度和方便使用,Imaris 使用丰富的渲染模式选择,实时可视化体积图像和目标。基于强度和尺寸,自动或手动鉴别目标。通过等位面应用一个针对任何通道数据的强度阈值,产生一个数据模式,显示为一个刚性表面。等位面能结合任何其他的视觉效果,产生非凡的图像。
4、通过在原来体积图像上叠加目标,实现有效的分割。个别目标的交互操作。仅用少量几次的鼠标操作,就可以创建出最令人印象深刻的图像。
5、整个的Surpass 场景功能能在框架目标中的3 个面上产生阴影投影。有:最大强度投影,混合投影,普通阴影,
阴影投影和最小强度投影5 种模式。对切片,切面,图像库,Surpass 正交面,Surpass 斜切面和Surpass 体积进行渲染。
6、表面剪刀功能;剪辑平面功能和体积描绘功能。地形学目标显示对象表面型貌。
7、标度功能使用户可以在 3D 图像后面显示标度网格,为图像提供其结构尺寸信息。
8、对于时间系列多维数据,用时间滑块,扩展了所有的 3D 功能至3D + 时间。
9、导航窗口能全景显示图像数据,并实时显示观察区域。
10、动画功能户能够轻而易举地创建电影(放大、缩小、移动、任意角度、飞入和飞出和随时间变化的动态)。
11、能打开和渲染巨大尺寸的图像。图像数据尺寸可以是超过计算机物理内存的。
二、Imaris MeasurementPro (Imaris 测量模块)
Imaris MeasurementPro 是在Imaris 进行特别的体积渲染,表面渲染和目标检测功能上,加入了几何学和强度测量功能。
有 3 个部分:
• Imaris 的功能延伸,对体元和次生目标统计测量数据进行自动计算和显示。
• 也可手动进行距离测量。
• 通过2D 图像上手动描绘轮廓方法,建立3D 表面。并进行自动测量形态学参数。
特点:
1、定量可视化信息:建立在Imaris 体积渲染,表面渲染和目标切面功能上的几何学和强度测量。比如,自动测量
3 维成像后的一块组织中各种细胞的相对绝对分布量,单个细胞或总体细胞的体积,表面积,荧光强度,光密度(见
如下所列参数)等各种形态学参数。
2、测量 3D 距离:让你在Imaris 生成的目标中定义点,然后迅速测出他们之间的距离。
3、强度检测:获得被选体元组强度的精确测量。
• 积分,标准差,中位数,最小值,最大值,质心
点
– 面积(总)
– 所有通道强度中心(平均)
– 所有通道强度平均(平均)
– 点数目(总)
– 体积(总)
– 体积
– 所有通道数据强度平均
– 所有通道数据强度标准差
– 所有通道数据强度总和目标表面
– 面积
– 椭圆度(, 扁度)
– 椭圆度(伸展度)
– 球面度
– 所有通道最小强度
– 所有通道最大强度
– 所有通道平均强度
– 所有通道中位强度
– 所有通道强度标准差
– 所有通道强度总和体积
三、Imaris Track (Imaris 三维运动寻迹模块)
追踪独立目标在三维空间随时间的变化和运动。目标可以是表面目标或者是点目标。两种类型的目标均可以用自动或手动方法创建。
特点:
1、自动构建轨迹:轨迹可以从等位面或点获得。 3D 预览帮助寻找适当的分割参数并自动创建轨迹。
2、编辑轨迹:轨迹编辑器让你方便地修正目标间的连接。连接可以是一对一,一对多(分散的),多对一(合并的),或多对多。