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EP1™高通量基因分析系统是集成流体通路（Integrated Fluidic Circuit，IFC）技术、终点PCR技术及强大的基因分析软件相结合的技术平台。其创新技术就在于集成液体通路技术：利用集成电路制作工艺（光刻）在硅片或石英玻璃上刻上许多微管和微腔体，通过不同的控制阀门控制溶液在其中的流动来实现生物样品的分液、混合、PCR扩增。集成流体通路技术极大地简化了生物样品和试剂的分液操作，提高分析通量和灵敏度，其纳升级的反应体系为高通量的基因分析应用节省大量成本（试剂用量更少，样品量更少）。 |
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EP1™高通量基因分析系统由EP1™ Reader，PCR仪、IFC微液流芯片（耗材）、IFC Controller（将生物样品、反应试剂导入到IFC微液流芯片中）和基因分析软件四部分构成。IFC微液流芯片有2种：Dynamic Array（48.48动态芯片和96.96动态芯片）和Digital Array（12.765数码芯片和48.770数码芯片），应用于不同的基因分析中：拷贝数变化分析、遗传突变检测、基因分型等。
从下面的具体应用及跟传统基因分析方法的比较上，我们可以很直观地看到EP1™高通量基因分析系统在通量、灵敏度、灵活度上的革命性的突破。 1.EP1™ Digital Array数码芯片 :
样本与试剂只需纳升级 (nl)
比传统方法少1,000倍, 大幅减少试剂用量
通过IFC部件, 样本浓缩1000倍, 敏感度大大提高，检测更准确，能检测到单拷贝, 高重复性
使用传统试剂, 操作简单快捷, 省去再开发时间
应用广泛, 如样本定量 (Slingshot), CNV, Haplotype, 遗传病/突变检测等
（1）Slingshot系统 : 第二代测序仪样本浓度确定
——无需参照样本, 绝对定量, 高效替Roche GS 454、ABI SOLiD和Illumina Solexa等第二代测序平台上机前作样品浓度准确定量，可大大减少试剂用量！ |
 | （2）拷贝数变化 / 遗传病 / 突变检测
| 拷贝数变化（Copy Number Variation, CNV）广泛用于药物代谢、癌症、免疫相关疾病、人类基因组变异以及由基因变异引起的相关疾病的研究。 EP1TM Digital Array
采用 12x765阵列PCR反应芯片，通过数字PCR，每个反应体系用量仅6 nL, 可有效分辨12与13倍（或更高）的差异。
采用常规PCR 方法和试剂, 无需改变工作流程, 结果一目了然, 方便比较
最多能兼容4种荧光染料， 进行多通道PCR 而传统分析方法 ： SNP微阵列分析或比较性基因组杂交(CGH)
敏感性和分辨率较低，缺乏客观标准，不能准确量化结果
操作烦琐, 需要大量本试剂， 假阳性非常高 常规qPCR技术:
最多只能分辨2与3倍的DNA拷贝数差异， 试剂价钱昂贵。 |
| 2.Dynamic Array 动态芯片：
高通量，最高每次可处理9216个qPCR反应（96样本× 96基因）
采用常规试剂方法, 用量为传统1% （反应为nl级）
无需繁琐加样, IFC全自动进样混合,减少人为误差
利用IFC技术自动操作，重复性好
样品、反应液组合自由多样，应用广泛，用户弹性大 基因分型
| ——通过简单加样，EP1™ 基因分析系统能在短时间内分析成千上万个基因 （96×96 / 48×48）：
更少试剂用量、更低成本
所以常规方法但更高通量
更高检出率（Call Rate），>99.5%
更快更高效，可日处理7万个基因型 |
| 对2000个样品进行基因分型时，使用384微孔板与48.48 Dynamic Array的对比结果：
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384微孔板 |
48.48动态阵列 |
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总运行次数 |
250 |
42 |
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同时运行反应数 |
384 |
2,304 |
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总移液次数 |
192,000 |
4,032 |
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总反应体积 |
480 ml |
5.1 ml |
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综合评定EP1™高通量基因分析系统，
· IFC整合系统，简化传统PCR操作步骤，使操作流程简化至1/48（48.48动态芯片）或1/96（96.96动态芯片）。
· 基因分型结果与ABI 7900 荧光定量数据具有很好的一致性。
· 重复性好，批内批间相关系数极高，p=00.0000。
· 高通量，Dynamic Array最多可实现9216个样本的同时检测，Digital Array一张芯片上最多可同时进行10,000(12.765数码芯片)或37,000（48.770数码芯片）个反应。
· nl级反应体系，比传统试剂耗费减少100倍，成本消耗节省一倍以上。
· 人性化数据分析软件，使您更加灵活的得到可靠数据。
在实际的科研应用中，越来越多的报导显示了EP1™基因分析系统正迅速地被科研工作者应用到实际研究中：
而大量高影响因子文章的陆续发表，更印证着Bio-Mark™基因分析系统在基因分析领域开创性的贡献， http://www.fluidigm.com/technology/publications.html。相信随着Bio-Mark™基因分析系统的推广和深入应用，更多的惊喜将呈现给科研工作者。
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