BioMark高通量基因分析系统-分子生物实验仪器-仪器设备-生物在线
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BioMark高通量基因分析系统

BioMark高通量基因分析系统

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产品名称： BioMark高通量基因分析系统

英文名称： BioMark

产品编号： BioMark

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产品产地： 美国

品牌商标： Fluidigm

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BioMark™高通量基因分析系统是集成流体通路（Integrated Fluidic Circuit，IFC）技术、实时定量PCR技术及强大的基因分析软件相结合的技术平台。其创新技术就在于集成液体通路技术：利用集成电路制作工艺（光刻）在硅片或石英玻璃上刻上许多微管和微腔体，通过不同的控制阀门控制溶液在其中的流动来实现生物样品的分液、混合、PCR扩增。集成流体通路技术极大地简化了生物样品和试剂的分液操作，提高分析通量和灵敏度，其纳升级的反应体系为高通量的基因分析应用节省大量成本（试剂用量更少，样品量更少）。
BioMark™高通量基因分析系统由BioMark™实时PCR系统（整合了高性能计算机）、IFC微液流芯片（耗材）、IFC Controller（将生物样品、反应试剂导入到IFC微液流芯片中）和基因分析软件四部分构成。IFC微液流芯片有2种：Dynamic Array（48.48动态芯片和96.96动态芯片）和Digital Array（12.765数码芯片和48.770数码芯片），应用于不同的基因分析中：拷贝数变化分析、遗传突变检测、基因分型、基因定量、单细胞基因表达等。
从下面的具体应用及跟传统基因分析方法的比较上，我们可以很直观地看到BioMark™高通量基因分析系统在通量、灵敏度、灵活度上的革命性的突破。
1.BioMark™ Digital Array数码芯片 :
  • 样本与试剂只需纳升级 (nl)
  • 比传统方法少1,000倍, 大幅减少试剂用量
  • 通过IFC部件, 样本浓缩1000倍, 敏感度大大提高，检测更准确，能检测到单拷贝, 高重复性
  • 使用传统试剂, 操作简单快捷, 省去再开发时间
  • 应用广泛, 如样本定量 (Slingshot), CNV, Haplotype, 遗传病/突变检测等
    • （1）BioMark Slingshot 系统 : 第二代测序仪样本浓度确定

    ——无需参照样本, 绝对定量, 高效替Roche GS 454、ABI SOLiD和Illumina Solexa等第二代测序平台上机前作样品浓度准确定量，可大大减少试剂用量！
    （2）拷贝数变化 / 遗传病 / 突变检测
    拷贝数变化（Copy Number Variation, CNV）广泛用于药物代谢、癌症、免疫相关疾病、人类基因组变异以及由基因变异引起的相关疾病的研究。
    BioMarkTM Digital Array
  • 采用 12x765阵列PCR反应芯片，通过数字PCR，每个反应体系用量仅6 nL, 可有效分辨12与13倍（或更高）的差异。
  • 采用常规PCR 方法和试剂, 无需改变工作流程, 结果一目了然, 方便比较
  • 最多能兼容4种荧光染料， 进行多通道PCR
    •  
    而传统分析方法 ：
    SNP微阵列分析或比较性基因组杂交(CGH)
  • 敏感性和分辨率较低，缺乏客观标准，不能准确量化结果
  • 操作烦琐, 需要大量本试剂， 假阳性非常高
    • 常规qPCR技术:
  • 最多只能分辨2与3倍的DNA拷贝数差异， 试剂价钱昂贵。
    		•
    2.Bio-Mark™ Dynamic Array 动态芯片：
  • 高通量，最高每次可处理9216个qPCR反应（96样本× 96基因）
  • 采用常规试剂方法, 用量为传统1% （反应为nl级）
  • 无需繁琐加样, IFC全自动进样混合,减少人为误差
  • 利用IFC技术自动操作，重复性好
  • 样品、反应液组合自由多样，应用广泛，用户弹性大
    •  
    （1）基因表达
  • 样本量为nl 级,
  • 能有效进行单细胞基因表达研究
  • 适合干细胞/ 癌细胞研究
    		•
    （2）基因分型
    ——通过简单加样，BioMark™ 基因分析系统能在短时间内分析成千上万个基因 （96×96 / 48×48）：
  • 更少试剂用量、更低成本
  • 所以常规方法但更高通量
  • 更高检出率（Call Rate），>99.5%
  • 更快更高效，可日处理7万个基因型
    		•   
    对2000个样品进行基因分型时，使用384微孔板与48.48 Dynamic Array的对比结果：

     
    384微孔板
    48.48动态阵列
    总运行次数
    250
    42
    同时运行反应数
    384
    2,304
    总移液次数
    192,000
    4,032
    总反应体积
    480 ml
    5.1 ml
     
    综合评定BioMark™高通量基因分析系统，

    ·  IFC整合系统，简化传统荧光定量PCR操作步骤，使操作流程简化至1/48（48.48动态芯片）或1/96（96.96动态芯片）。
    ·  与ABI 7900 荧光定量数据具有很好的统一性。
    ·  重复性好，批内批间相关系数极高，p=00.0000。
    ·  高通量，Dynamic Array最多可实现9216个样本的同时检测，Digital Array一张芯片上最多可同时进行10,000(12.765数码芯片)或37,000（48.770数码芯片）个反应。
    ·  nl级反应体系，比传统试剂耗费减少100倍，成本消耗节省一倍以上。
    ·  人性化数据分析软件，使您更加灵活的得到可靠数据。
    在实际的科研应用中，越来越多的报导显示了BioMark™基因分析系统正迅速地被科研工作者应用到实际研究中：

    ·  美国国家癌症研究所采用Fluidigm(富鲁达)公司的96.96动态阵列，以高成本效益对全基因组SNP联合扫描进行快速深入的研究

    而大量高影响因子文章的陆续发表，更印证着Bio-Mark™基因分析系统在基因分析领域开创性的贡献，
    http://www.fluidigm.com/technology/publications.html。相信随着Bio-Mark™基因分析系统的推广和深入应用，更多的惊喜将呈现给科研工作者。
    更多信息请访问：   www.fluidigm.com