Affymetrix全基因组表达谱芯片服务
产品名称: Affymetrix全基因组表达谱芯片服务
英文名称: Affymetrix
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美国Affymetrix公司GeneChip®基因表达谱芯片服务
服务简介
美国 Affymetrix 公司是全球基因芯片行业的领先者,于1989年研制出了世界首张基因芯片,并从1996年开始正式销售商用基因芯片。其专利的寡核苷酸原位光刻合成技术将芯片上的信息储量最大化,使研究工作者们可以通过全基因组研究对遗传学与健康之间的关系进行分析。在十多年的研究开发中,其 GeneChip® 技术一直以行业标准著称分子生物研究领域。Affymetrix公司在世界范围内售出超过1200套系统,并有4000余篇论文使用了该技术获得的成果。
Affymetrix 公司的 GeneChip® 系列产品包括表达谱芯片、基因组分型芯片,Exon Array、Tilling Array等。
芯片实验流程
A、芯片实验过程,包括所用试剂和仪器 B、RNA提取质检结果,包括电泳图,OD值 C、芯片扫描原始图片(Scanning image) D、芯片扫描原始信号数据(Raw data) E、两个样品的信号值散点图(Scatter plot) F、差异基因列表,设定两个样品间Fold change >=2,p-value<=0.05的基因为差异基因,并给出列表及其注释 H、cluster聚类分析结果(芯片张数必须大于3张)、pathway分析结果、GO功能分析结果 聚类分析图:
差异基因列表: GO功能显著性分析:
GO功能分类饼图:
Pathway显著性分析:
服务周期 客户只需提供样品(组织样品、Trizol样品、total RNA样品等)即可,从送出样品至得到实验报告的时间约为1个月。 实验报告
芯片名称 | 基因/转录本数量 |
人(Homo sapiens)基因组U133 +2.0 芯片 | 38,500 个基因/ 47,000个转录本 |
人(Homo sapiens)外显子1.0ST芯片 | >1 million外显子 |
人(Homo sapiens)基因1.0ST芯片 | 28,869 个基因 |
小鼠(Mus musculus)基因组430 2.0 芯片 | 34,000个基因 / 39,000个转录本 |
小鼠(Mus musculus)外显子1.0ST芯片 | ~1 million外显子 |
小鼠(Mus musculus)基因1.0ST芯片 | 28,853个基因 |
大鼠(Rattus norvegicus)基因组230 2.0 芯片 | 28,000个基因 / 30,000个转录本 |
大鼠(Rattus norvegicus)外显子1.0ST芯片 | 850,000外显子 |
大鼠(Rattus norvegicus)基因1.0ST芯片 | 27,342 个基因 |
恒河猴(Macaca mulatta)基因组芯片 | 47,000 个转录本 |
狗(Canis familiaris)基因组芯片 | 20,000预测基因和18,000家犬转录本 |
猪(Sus scrofa)基因组芯片 | 20,201个基因 / 23,256个转录本 |
牛(Bos taurus)基因组芯片 | 23,000个转录本 |
鸡(Gallus gallus)基因组芯片 | 28,000个基因 /32,773个鸡转录本和684个鸟类病毒转录本 |
斑马鱼(Danio rerio)基因组芯片 | ~14,900个转录本 |
非洲爪蟾(Xenopus laevis)基因组2.0芯片 | 29,900 个转录本 |
热带爪蟾(Xenopus tropicalis)基因组芯片 | 51,000 个转录本 |
果蝇(Drosophila melanogaster)基因组2.0芯片 | ~18,500 个转录本 |
疟原虫/疟蚊(Plasmodium falciparum-Anopheles gambiae)基因组芯片 | 4,300 个疟原虫转录本/ |
14,900个疟蚊转录本 | |
秀丽隐杆线虫(Caenorhabditis elegans)基因组芯片 | 22,500 个转录本 |
拟南芥(Arabidopsis thaliana)ATH1表达谱芯片 | 24,000 个基因 |
水稻(Oryza sativa)基因组芯片 | 48,564个 Japonica转录本; |
1,260个 Indica 转录本 | |
小麦(Triticum aestivum)基因组芯片 | 55,052 个转录本 |
玉米(Zea mays)基因组芯片 | 13,339个基因; |
100种玉米品系的14,850个转录本 | |
苜蓿(M. truncatula/ M. sativa/S. meliloti)基因组芯片 | 48,116 (M. truncatula) / 1,850 (M. sativa) / 8,226 (S. meliloti)个转录本 |
白杨(Populus sp.)基因组芯片 | ~56,000 转录本及预测基因 |
柑橘(Citrus sinensis)基因组芯片 | 30,171个基因和33,879个转录本 |
大豆(Glycine max)基因组芯片 | 37,500 (大豆) /15,800 (大豆疫霉菌)/7,500 (大豆孢囊线虫)个转录本 |
大麦(Hordeum vulgare)基因组芯片 | 400,000 EST |
甘蔗(Saccharum officinarum)基因组芯片 | 6,024个基因 |
番茄(Lycopersicon esculentum)基因组芯片 | 9,200 个转录本 |
棉花(Gossypium spp.)基因组芯片 | 21,854 个转录本 |
酿酒葡萄(Vitis vinifera)表达谱芯片 | 14,000 V. vinifera个转录本;1,700个 其他葡萄属转录本 |
测试3芯片 | |
大肠杆菌(Escherichia coli)基因组 2.0 芯片 | 20,366 个基因 |
酵母(Saccharomyces cerevisiae/Schizosaccharomyces pombe)基因组 2.0 芯片 | 5,841 (酿酒酵母) 和5,031 (裂殖酵母)个转录本 |
金黄色葡萄球菌(Staphylo, coccus aureus)基因组芯片 | 3,300 ORF和 4,800 基因间区序列 |
枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)基因组芯片 | 5,000个基因 |
绿脓杆菌(Pseudomonas aeruginosa)基因组芯片 | 5,549 ORFs |
公司介绍
武汉言行生物科技有限公司提供各种蛋白质组学服务、代谢组学服务、高通量测序服务、生物芯片服务、荧光定量PCR服务、基因组编辑和整体课题外包等技术服务,成立于2008年。言行生物客户已发表《The Plant Journal》、《Proteomics》、《ES&T》、《PLoS ONE》、《BMC Genomics》等杂志。
公司以“言必信 行必果”为理念,竭力把更优的生物技术服务奉献给您!
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