长链非编码 RNA(long non-coding RNA,lncRNA)一般是指长度大于200个核苷酸的非编码RNA,其位于细胞核或胞浆中。新的证据显示lncRNAs在自身免疫的调节起着至关重要的作用。在过去的几年中,在类风湿关节炎(Rheumatoid Arthritis ,RA)患者中的lncRNA的修饰作用备受关注。然而,潜在的分子机制参与RA发病机制仍是未知。来自潍坊医学院附属医院的陆洪英课题组对RA患者和健康对照者的血清进行lncRNA芯片筛选和实时PCR验证,通过lncRNA差异表达、lncRNA-mRNA基因共表达网络和基因通路分析,筛选到73个上调IncRNAs和61个下调lncRNAs以及128个上调mRNA和37个下调mRNA。最终确定5个上调表达的lncRNAs与病程存在显著关联。本研究首次显示了在类风湿关节炎病人的血清中特定的lncRNAs和潜在的信号转导通路参与RA发病机制。为RA患者的诊断、治疗和预后评估提供了有希望的新靶点。结果发表在2017年的Oncotarget (IF=5.168)上。
本研究中,北京博奥晶典生物技术有限公司提供了博奥晶典人类长链非编码RNA芯片v4检测。
1 采用芯片筛选RA患者和健康对照者的差异基因及差异lncRNA
2 基于芯片结果的生物信息分析
差异mRNA的功能富集结果 lncRNA-mRNA的共表达分析结果
3 LncRNA验证qPCR结果
4 lncRNA差异表达与RA临床特征之间的联系
小编说 本研究首次揭示了类风湿关节炎患者血清中特定的lncRNAs和潜在的信号转导通路参与RA发病机制。探讨了类风湿关节炎患者中lncRNA的表达谱,提供了类风湿关节炎诊断和治疗的新方案。 本项研究的创新点和意义是:通过芯片技术筛选与肝类风湿关节炎密切相关的lncRNA,为类风湿关节炎患者的诊断、治疗和预后评估提供了有希望的新靶点。
Reference:
DonghuaXu, et al., Long noncoding RNAs expression profile and functionalnetworks in rheumatoid arthritis. Oncotarget. 2017 .
作者简介
徐栋花 主治医师/医学博士
南京医科大学免疫学硕士,风湿病学博士。现任潍坊医学院附属医院风湿科主治医师,主要从事RA、SLE等风湿病发病机制与免疫调控机制研究。主持国自然青年基金1项,省自然青年基金1项。发表SCI论文10余篇。
博奥晶典人lncRNA检测产品 博奥晶典人类长链非编码RNA芯片v4是北京博奥晶典与中国科学院生物物理研究所陈润生院士课题组共同开发的人类长链非编码RNA(lncRNA)和mRNA研究芯片。 自2012年至今,人lncRNA+mRNA表达谱芯片已经完成食道癌、肺癌、肾细胞癌、肝癌、卵巢癌、甲状腺肿瘤、结肠癌、舌癌、胶质瘤、乳腺癌、宫颈癌等十余种肿瘤的相关研究,检测总样品数超过4500个,为224家单位提供了科研服务。 科研服务助21家单位发表30篇文章,影响因子总计超过114分。 博奥晶典人类长链非编码RNA芯片v4服务于2015年获得了北京市新技术新产品(服务)证书。
博奥晶典科研服务事业部余琛、吴洁、张西轩 | 文案
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