解读 | lncRNA与血管内皮细胞凋亡过程的是是非非
-博奥晶典科研服务-ncRNA,lncRNA研究领域新发现!
研究背景
近年来,越来越多的证据表明lncRNA(长链非编码RNA)可以通过多个水平改变基因的表达,进而在生物过程中起到关键调节子的作用。血管内皮细胞的凋亡与多种心血管疾病相关联,如动脉粥样硬化和血栓形成等。然而在心血管系统中的lncRNA研究才刚刚起步。到目前为止,在血管内皮细胞中还没有发现与抗凋亡相关的lncRNA。
来自山东大学苗俊英(教授)课题组的路玮等,利用博奥晶典的lncRNA芯片发现LOC100129973能够作为miRNA海绵体,与miRNA-4707-5p和miRNA-4767miRNA结合,最终降低由于血清和生长因子缺乏所引起的血管内皮细胞的凋亡。该lncRNA作为血管内皮细胞凋亡的抑制剂,为确定内皮细胞凋亡相关心血管疾病治疗的新靶点提供证据。相关结果发表在2016年的Scientific Reports上(IF=5.525)。
本研究中,北京博奥晶典生物技术有限公司提供了lncRNA芯片检测服务和生物信息分析服务。
技术路线
结果展示
1. 三种培养条件下,加入ABO可以抑制饥饿引起的血管内皮细胞的凋亡
作者对血管内皮细胞培养采用三种条件,发现ABO存在的情况下,可抑制因为饥饿导致的细胞凋亡。
图注:Nor:正常培养; Ctr:去血清去生长因子诱导内皮细胞凋亡;ABO:去血清去生长因子的条件下加入ABO;
三种实验分析血管内皮细胞凋亡:A细胞形态观察;B 丫啶橙染色;C TUNEL染色。
2. ABO处理细胞时,差异表达基因筛选及验证
在ABO培养条件下,长非编码RNA LOC100129973显著上调。
图注:左图:芯片筛选到的差异lncRNA情况; 右图:A.LOC100129973在基因组上的情况;B.3种培养条件下LOC100129973的RT-PCR结果。
3. 确定长非编码RNA LOC100129973对凋亡的作用
LncRNA LOC100129973可以抑制血管内皮细胞因血清和FGF-2饥饿诱导的细胞凋亡。
图注:A.LOC100129973过表达和敲低的RT-PCR验证;B.染色实验;C,D.切割切割PARP的Western Blot实验。
4. 长非编码RNA LOC100129973可以作为miRNA海绵体,负调控miRNA 4707-5p和miRNA 4767
lncRNA LOC100129973可发挥miRNA海绵体的作用,对两个miRNA进行调控。
小编说
血管内皮细胞的凋亡与多种心血管疾病相关联,如动脉粥样硬化和血栓形成等。越来越多的证据表明lncRNA可以通过多个水平改变基因的表达,进而在多个生物过程中起到关键调节子的作用;但目前在心血管系统中的长非编码RNA研究才刚刚起步,尚未发现在血管内皮细胞中抗凋亡的lncRNA。本研究发现的一个lncRNA能够抑制由于去血清去生长因子引起的血管内皮细胞的凋亡。而且该lncRNA能够作为miRNA海绵体,与miRNA-4707-5p和miRNA-4767这两个miRNA结合,进而上调两者的靶基,最终降低由于血清和生长因子缺乏所引起的血管内皮细胞的凋亡。
本文的研究证明lncRNA可作为提高内皮功能的有效靶标,也为确定内皮凋亡相关心血管疾病治疗的新靶点提供证据。
Reference:
Lu, W., et al. Long Noncoding RNA LOC100129973 Suppresses Apoptosis by Targeting miR-4707-5p and miR-4767 in Vascular Endothelial Cells. Scientific Reports 6(2016).
作者简介
苗俊英 教授
武汉大学细胞生物学学士,武汉大学生物物理学硕士,名古屋大学理学博士。主要从事血管内皮细胞增殖、分化和凋亡分子机制研究,以及神经元存活与凋亡分子机制研究。现任山东大学教授,从事发育生物学和细胞生物学教学工作。多次承担国家重大的科研项目,并已获得多项发明**。
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科研服务事业部 颜世磊、吴洁、张西轩 | 文案
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