“RNA类明星”的正确集合方式-ceRNA
博奥晶典带您走进
RNA的明星世界~
RNA家族的众多成员,
历来都是科研工作者热爱的研究对象:
是不是已经眼花缭乱,选择障碍啦!
不必再犹豫,现在,有一种研究,可以把多种RNA结合在一起,集RNA于大成,那就是----ceRNA!如果说,miRNA,lncRNA,circRNA每一个都散发出耀眼的光芒,ceRNA则让我们看到它们之间的关联和更多的潜力。
什么是ceRNA?
ceRNA(competing endogenous RNAs)是一种最新发现的基于RNA的调节机制,涉及多种RNA分子。发挥ceRNA作用的,可以是mRNA、假基因、lncRNA、circRNA等等。这些RNA一般具有如下特征:
1)具有MRE,即miRNA反应原件;
2)能够竞争性结合miRNA,最终发挥抑制miRNA对靶基因调控的作用。
ceRNA 研究现状
国自然ceRNA资助项目,从无到有,现在正经历着跃式增长。如同以lncRNA为主题的标书是肿瘤研究的最大赢家,以ceRNA为主题的标书也有相似的趋势。
国自然资助ceRNA项目数量
是不是有老师会想,今年怎么就没想到写ceRNA相关的本子啊?有想法永远不会迟,请抓紧联系北京博奥晶典生物有限公司吧(010-69002900),我们为您提供一站式ceRNA检测分析服务,早早准备好,不要错过明年的国自然盛宴!
以肿瘤为例,近年来国内外科研工作者发现,ceRNA介导参与肺癌,胃癌,肝癌,乳腺癌,前列腺癌,结直肠癌,淋巴瘤,内皮细胞癌,黑色素瘤,胶质母细胞瘤等人类肿瘤的发生发展(Avencia Sanchez-Mejias and Yvonne Tay,2015)。这些实体瘤和血液循环系统恶性肿瘤中的研究均显示,ceRNA在癌症发病机制中起到了重要的作用,影响了关键致癌基因活抑癌基因的表达,并且可以作为癌症治疗的潜在靶标(Wang Y, et al., 2016)。
国内ceRNA与癌症研究正如火如荼得展开。早在2014年,宁波大学医学院的研究人员对胃癌中与lncRNA有关的竞争性内源RNA展开了分析(guo et al., 2014),首次构建了lncRNA-miRNA-mRNA网络。随后,引用头颈部鳞癌、前列腺癌、甲状腺乳头状癌、垂体促性腺激素肿瘤、卵巢癌、慢性淋巴细胞白血病等6种癌症的数据对这一网络进行验证,研究结果揭示了一个明确的癌相关的ceRNA网络。又如,来自西南医科大学的研究者(Huang M .et al,2016)及山东大学附属省立医院的研究者(Hanbo Wang. et al.,2016)分别对前列腺癌,中南大学第三湘雅医院的研究者对结直肠癌(Wu H. et al., 2017),山东大学附属省立医院的研究者对膀胱癌开展了ceRNA分析。
当然,ceRNA研究不仅仅局限于癌症研究领域,例如,北京博奥晶典生物技术有限公司支持支持山东大学苗俊英课题组研究者们采用博奥晶典人类长链非编码RNA芯片v4进行了血管内皮细胞凋亡相关的ceRNA机制;相关结果发表在2016年的scientific reports上(Lu, et al., 2016)。
参考文献:
[1] Wang Y, et al., The Emerging Function and Mechanism of ceRNAs in Cancer. Trends Genet. 2016 Feb 24;pii:S0168-9525(16)00016-0. doi:10.1016/j.tig.2016.02.001.
[2] Long noncoding RNA associated-competing endogenous RNAs in gastric cancer. Sci Rep. 2014;6088. pii:srep06088. doi:10.1038/srep06088;
[3] Huang M et al., Comprehensive analysis of differentially expressed profiles of lncRNAs and circRNAs with associated co-expression and ceRNA networks in bladder carcinoma. Oncotarget. 2016 May 30;pii:9706. doi:10.18632/oncotarget.
[4] Wu H et al., Comprehensive analysis of differentially expressed profiles of lncRNAs and construction of miR-133b mediated ceRNA network in colorectal cancer. Oncotarget. 2017 Feb 03;pii:15045. doi:10.18632/oncotarget
[5] Hanbo Wang et al., Comprehensive analysis of aberrantly expressed profiles of lncRNAs and miRNAs with associated ceRNA network in muscle-invasive bladder cancer. Oncotarget. 2016 Dec 27;7(52):86174-86185. doi: 10.18632/oncotarget.13363.
[6] Lu, W., et al. Long Noncoding RNA LOC100129973 Suppresses Apoptosis by TargetingmiR-4707-5p and miR-4767 in Vascular Endothelial Cells.Scientific Reports 6 (2016).
[7] Avencia Sanchez-Mejias and Yvonne Tay. Competing endogenous RNA networks: tying the essential knots for cancer biology and therapeutics. Journal of Hematology & Oncology (2015) 8:30. DOI 10.1186/s13045-015-0129-1
说了这么多,ceRNA研究到底怎么做呢?
且听下回分解。
博奥晶典科研服务事业部李青、吴洁、张西轩 | 编辑
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